motif分析软件-----Homer的安装
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了motif分析软件-----Homer的安装相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
1.下载相关程序:
网址:http://homer.ucsd.edu/homer/download.html
下载其中名为configureHomer.pl的文件。
2.新建文件夹:homer
mkdir homer
3.将刚下载的pl文件移至Homer文件夹中:
mv configureHomer.pl homer
4.开始安装Homer软件:
Perl /home/lmt/desktop/homer/configureHomer.pl -install (根据自己的confihureHomer.pl所在的路径更改)
5.老生常谈,将可执行的二进制文件的路径添加至环境变量文件中
vi ~/.bashrc
6.在.bashrc文件的最后一行加上一下内容:
export PATH=/home/lmt/desktop/homer/bin:$PATH
7.激活刚刚添加的环境变量文件:
source .bashrc
8.
以上是关于motif分析软件-----Homer的安装的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
ChIP-Seq数据挖掘系列-5.2: ngs.plot 画图工具ngs.plot.r 和 replot.r 参数详解