motif分析软件-----Homer的安装

Posted 爬行的乌龟

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了motif分析软件-----Homer的安装相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1.下载相关程序:

网址:http://homer.ucsd.edu/homer/download.html

下载其中名为configureHomer.pl的文件。

2.新建文件夹:homer

mkdir homer

3.将刚下载的pl文件移至Homer文件夹中:

mv configureHomer.pl homer

4.开始安装Homer软件:

Perl /home/lmt/desktop/homer/configureHomer.pl -install (根据自己的confihureHomer.pl所在的路径更改)

5.老生常谈,将可执行的二进制文件的路径添加至环境变量文件中

vi ~/.bashrc

6.在.bashrc文件的最后一行加上一下内容:

export PATH=/home/lmt/desktop/homer/bin:$PATH

7.激活刚刚添加的环境变量文件:

source .bashrc

8.

以上是关于motif分析软件-----Homer的安装的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

Homer预测共表达基因的motif

ChIP-Seq数据挖掘系列-5.2: ngs.plot 画图工具ngs.plot.r 和 replot.r 参数详解

如何在 Windows 7 上安装 Web 应用程序压力工具 (WAST) (homer)

meme suite —— Motif分析百宝箱(二)

基因家族分析(2) ggplot2绘制motif分析图

fimo: 扫描motif时需留心的小坑