ChIP-Seq数据挖掘系列-5.2: ngs.plot 画图工具ngs.plot.r 和 replot.r 参数详解

Posted 2023-04-27

参考技术A

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ChIP-Seq 数据挖掘系列文章目录：
ChIP-Seq数据挖掘系列-1:Motif 分析(1)-HOMER 安装
ChIP-Seq数据挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步骤
ChIP-Seq数据挖掘系列-3: Motif 分析(3) - 利用ChIP-Seq结果在基因组区域中寻找富集的Motifs
ChIP-Seq数据挖掘系列-4: liftOver - 基因组坐标在不同基因组注释版本间转换
ChIP-Seq数据挖掘系列-5.1: ngs.plot 可视化ChIP-Seq 数据
ChIP-Seq数据挖掘系列-5.2: ngs.plot 画图工具ngs.plot.r 和 replot.r 参数详解
ChIP-Seq数据挖掘系列-6: 怎么选择HOMMER结果中的motif

转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq

做生物想发文章怎么办？转录调控来解析（huyou）！

最简单的情形：

1. 我在研究一个非常重要的基因A，功能已经做得差不多了，现在想深挖，第一步就是想知道哪个转录因子调控这个基因A；

2. 我发现了一个新颖的转录因子B，非常想知道这个B到底再调控哪个基因。

 

研究方法不过几种：

1. 基于大量的ChIP-seq公共数据挖掘；

2. motif分析预测；

3. 做实验验证，DNase/ATAC-seq；

 

 

待续~

 

参考：嘉因