转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq

Posted Digital-LI

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

做生物想发文章怎么办?转录调控来解析(huyou)!

最简单的情形:

1. 我在研究一个非常重要的基因A,功能已经做得差不多了,现在想深挖,第一步就是想知道哪个转录因子调控这个基因A;

2. 我发现了一个新颖的转录因子B,非常想知道这个B到底再调控哪个基因。

 

研究方法不过几种:

1. 基于大量的ChIP-seq公共数据挖掘;

2. motif分析预测;

3. 做实验验证,DNase/ATAC-seq;

 

 

待续~

 

参考:嘉因

 

以上是关于转录调控实战 | 一文解决转录调控问题 | chIP-seq | ATAC-seq的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

转录因子实验研究方法都有哪些?

细菌的转录翻译调控

数据挖掘,你还可以这样做(上)

什么是转录因子?

易基因:ChIP-seq等揭示热休克转录因子A1b调控植物高温胁迫响应的分子机制|应激反应

易基因:2023年植物表观转录组研究的最新进展(m6A+m5C)|深度综述