RNA-Seq分析软件HTSeq的安装

Posted 2020-10-06 爬行的乌龟

1.本人刚开始安装的时候，先下载相关的软件包，然后安装installtion中的方法安装，

 运行的时候老是报错。根据错误提示安装解决方法。也参考了其他的笔友的一些建议，

发现特别麻烦，后来无意中发现有小伙伴用bioconda来安装，一个命令，简单快捷。

2.bioconda安装HTSeq操作如下：

下载安装miniconda(即bioconda)。

添加channels

等等

（具体步骤参考本人的相关bioconda的博客）

安装HTSeq的命令如下：

conda   install  HTSeq

输入上述命令，根据提示操作，可能有点慢。

安装完成后，测试一下HTSeq安装是否成功。

$ python(HTSeq在Python中运行)

>>> import HTSeq

上述操作Import HTSeq如果没有返回任何信息，

说明安装成功。

PS：bioconda真心好用啊，但是好像不是所有的安装都是

conda install softname，好像有的软件需要其他的参数

记着就好啦，反正暂时没有遇到。