HumanNet v2：用于疾病研究的人类基因网络 X科研网

Posted 2022-01-08 wangshicheng

HumanNet v2：用于疾病研究的人类基因网络
人类基因网络已被证明在疾病研究的许多方面都很有用，已经开发了许多基于网络的策略来产生关于基因 - 疾病 - 药物关联的假设。预测和组织与特定疾病最相关的基因的能力已被证明是特别重要的。我们之前通过使用贝叶斯统计框架整合各种类型的组学数据，开发了人类功能基因网络HumanNet，并展示了其检索疾病基因的能力。在这里，我们介绍HumanNet v2（http://www.inetbio.org/humannet），这是一个人类基因网络数据库，通过整合新数据类型，扩展数据源和改进网络推理算法进行更新。 HumanNet现在包含人类基因网络的层次结构，允许更灵活地将网络信息纳入研究。 HumanNet在对疾病相关基因集进行排序方面表现良好，具有最小的文献依赖性偏差。我们观察到，合并模式生物“蛋白质 - 蛋白质相互作用并未显着改善疾病基因预测，这表明许多疾病基因关联现在直接在人类衍生数据集中捕获。通过改进的交互式用户界面进行疾病网络分析，我们期待HumanNet将成为网络医学的有用资源。