动态规划 洛谷P1140 相似基因

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了动态规划 洛谷P1140 相似基因相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

 P1140 相似基因

题目背景

大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了4种核苷酸,简记作A,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。

在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。

题目描述

两个基因的相似度的计算方法如下:

对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:

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这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:

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那么相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:

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相似度为:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。

输入输出格式

输入格式:

 

共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,T四个字母。1<=序列的长度<=100。

 

输出格式:

 

仅一行,即输入基因的相似度。

 

输入输出样例

输入样例#1:
7 AGTGATG
5 GTTAG
输出样例#1:
14



第一眼看到题,这不是最长公共子序列,然而我并没有写过,gg......
然后开始乱造,我觉得没人会和我一样用这么蠢的写法了......
 1 #include<iostream>
 2 #include<cstdio>
 3 #include<cstring>
 4 #include<algorithm>
 5 using namespace std;
 6 int val[300][300];
 7 int len1,len2;
 8 char s1[110],s2[110];
 9 int f[110][110];
10 int main(){
11     ios::sync_with_stdio(false);
12     val[A][A]=val[C][C]=val[G][G]=val[T][T]=5;
13     val[A][C]=val[C][A]=val[A][T]=val[T][A]=val[T][-]=val[-][T]=-1;
14     val[A][G]=val[G][A]=val[G][T]=val[T][G]=val[C][T]=val[T][C]=val[G][-]=val[-][G]=-2;
15     val[C][G]=val[G][C]=val[A][-]=val[-][A]=-3;
16     val[C][-]=val[-][C]=-4;
17     cin>>len1>>s1>>len2>>s2;
18     for(int i=1;i<=len1;i++) f[i][0]=f[i-1][0]+val[s1[i-1]][-];
19     for(int i=1;i<=len2;i++) f[0][i]=f[0][i-1]+val[s2[i-1]][-];
20     for(int i=0;i<=len1-1;i++)
21         for(int j=0;j<=len2-1;j++)
22             f[i+1][j+1]=max(max(f[i][j]+val[s1[i]][s2[j]],f[i+1][j]+val[-][s2[j]]),f[i][j+1]+val[s1[i]][-]);
23     cout<<f[len1][len2];
24     return 0;
25 }

 





















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