偏最小二乘库

Posted 2023-03-12

【中文标题】偏最小二乘库

【英文标题】：Partial Least Squares Library

【发布时间】：2012-07-13 02:49:05

【问题描述】：

已经有这样的问题，但没有回答，所以我尝试再次发布。有谁知道 C++（或 C）中 partial least squares algorithm 的开源实现？ 或者也许是一个图书馆？

【参考方案1】：

FastPLS 是一个提供 C/C++ 和 MATLAB 接口的库 用于加速偏最小二乘。它的作者是巴拉吉瓦桑 斯里尼瓦桑。作者在教授的指导下工作 Ramani Duraiswami，马里兰大学，学院公园，医学博士， 美国。 Partial Least Squares and Generalized Partial Least Squares models based on NIPALS algorithm。 使用matrix libraries如Armadillo自行实现 PLSNiplas, opencv 是必需的。

【讨论】：

建议 #2 (plstools) 似乎适用于 R，而不是 C 或 C++。

@Pukku 来自 c 代码包装器：标题：pls.c 描述：基于 NIPAS 算法的 pls 计算 C 引擎作者：Pierre BADY

好的，现在从 Subversion 签出项目时找到了。显然这个文件没有包含在提供的 v1.0-6 zip 存档中，所以我认为它不会存在。

或者使用Eigen 代替犰狳。我发现它更快更好。

【参考方案2】：

找到PLS NIPALS C++ 库，但还没有尝试过。

【参考方案3】：

MTK++ 是一个药物设计库。

它建立在各种基于矩阵的库之上，例如：

基本线性代数子程序 (BLAS)，线性代数包 (LAPACK)、Boost、eigen、Qt、tinyxml 和 xerces-c 库

它有一个partial least squares component。

它是开源的，但源代码不是在线托管的。你必须contact the author 才能得到它。

【参考方案4】：

在这里找到这个： https://github.com/tjhladish/PLS

它是 c++ 并使用 Eigen 库