CRAN 的 MacOS 的自制 R 和“标准”R 可以共存吗？

Posted 2023-02-25

【中文标题】CRAN 的 MacOS 的自制 R 和“标准”R 可以共存吗？

【英文标题】：Can homebrew R and "standard" R for MacOS from CRAN coexist?

【发布时间】：2019-11-25 11:30:09

【问题描述】：

我在运行 Sierra 的 Mac Mini 和运行 El Capitan 的 MacBook Pro 上运行 R 3.6.1。我通常会从 CRAN 或 github 获得我需要的所有 R 软件包并毫无问题地使用它们，但我正在尝试安装和使用需要 fortran 编译器和这给了我问题。即使安装了gfortran，R 包仍然不起作用（fortran 代码似乎编译成功但包安装失败）。软件包开发者建议通过homebrew 安装R 可能会解决问题。相反，我的预感是它会导致一个痛苦的世界，引用大莱博夫斯基的沃尔特的话。我的问题是：

与从 CRAN 安装的“常规”版本相比，MacOSX 的 R 的自制版本有什么优势？ 两个版本可以共存吗？ 自制版本会影响普通版本吗？

最后：自制软件会有所帮助还是会简单地打开一个整体 新的蠕虫罐头？

非常感谢。

【问题讨论】：

看看这里：owsiak.org/r-3-4-rjava-macos-and-even-more-mess也许这个对你有帮助。

记录在案：我描述的问题仍然存在于运行 El Capitan 的笔记本电脑上的 R 3.6.1 for Mac（来自 CRAN）上。相反，我设法在运行 Sierra 的 Mac Mini 上安装了该软件包。首先，我继续在其上安装自制软件，但我没有安装自制软件 R。相反，我安装了适用于 Sierra 的 gfortran，然后在从 CRAN 下载的适用于 Mac 的常规 R 3.6.1 上安装了 NicheMapR，这一次它工作了。我不知道安装自制软件是否会有所作为，也不知道为什么我的另一台机器上仍然存在问题，但这是领先一步。

【参考方案1】：

是的，从homebrew 安装是一个痛苦的秘诀。官方 CRAN 二进制维护者特别建议不要使用它，请参阅 his remarks from March 2016 on r-sig-mac。

关于您的问题，可以总结为：

R for MacOSX 的自制版本与从 CRAN 安装的“常规”版本相比有什么优势？

积极因素：选择您自己的 BLAS 并轻松使用地理空间工具。

缺点：总是需要编译每个R包。

这两个版本可以共存吗？

是的。 homebrew 版本安装到不同的目录中。但是，请注意库冲突（请参阅下一个问题）。但是，您将不得不处理有关可从控制台访问哪个版本的 R 的符号链接，并且您还需要考虑使用 RSwitch 在 R 之间切换版本。

自制版本会影响普通版本吗？

是的，如果库路径重叠。包安装和加载会有问题。确保设置不同的库路径。为此，请查看.libPaths() documentation。

最后：自制软件会有所帮助，还是会简单地打开一个全新的蠕虫罐？

是的，不是的。除非您知道自己在做什么，否则请选择 R 的 CRAN 版本及其各种好东西。

【讨论】：

等等——你说“总是需要编译每个 R 包”是使用自制软件的一个缺点。在 Mac OS 上，我们不是总是需要从源代码编译 R 包吗？

@KenWilliams CRAN 如果在 macOS 或 Windows 上为您执行此操作。只有 Linux 用户需要从源代码编译。不过，随着 RStudio 的包管理器的引入，可以为流行的 linux 发行版获取二进制文件。

我这辈子的知识在哪里！