CRAN 包检查和 R CMD 检查-as--cran 之间的差异

Posted 2023-02-19

【中文标题】CRAN 包检查和 R CMD 检查-as--cran 之间的差异

【英文标题】：Discrepancy between CRAN package check and R CMD check -as--cran

【发布时间】：2014-11-05 21:33:58

【问题描述】：

我想向 CRAN 存储库提交一个包 (DLMtool)。当我使用R CMD check --as-cran 检查包裹时，我只收到一条关于新提交的注释。

但是，当我提交包时，我收到了 R 核心团队关于我没有收到的错误的反馈。例如：

Quitting from lines 261-262 (DLMtool.Rnw)
Error: processing vignette 'DLMtool.Rnw' failed with diagnostics:
one node produced an error: NAs are not allowed in subscripted assignments 

我无法通过自己运行代码来重现此错误。但这不是这篇文章的重点：我不担心具体的错误，而是我自己无法检测到这些错误。到目前为止，Ripley 教授一直很有耐心。我非常不想再浪费他或任何 R 核心团队的时间，将它们用作一步一步的检查过程。

如果--as-cran不足，如何重新创建CRAN包检查流程？

据我所知，有人就以前版本的 R 提出了一个类似的问题，但没有得到令人满意的回答：

CRAN package check finds warning that R CMD check --as-cran doesn't

干杯，

汤姆

我使用的是 Windows 7 x64、RStudio 0.98.507 和 R 3.1.1 x64。

【问题讨论】：

CRAN 检查 R 的发布版本和开发版本；您可能只使用发布版本。

这可能是在 R-devel 中改变的东西，所以你需要使用它来运行你的测试。要在 Windows 上执行此操作，您需要从源代码构建 R。如果您以前没有这样做过，那可能会很乏味。我一直在收集some notes on how to do it here，如果您以前没有这样做过，您可能会发现它很有用。另一种方法是通过 Travis CI 之类的工具运行该软件包，这样您就不必在自己的机器上构建 R-devel。

devtools::build_win() 通常很有帮助

感谢 Dirk、Thomas 和 Hadley。这些现在在我的提交步骤列表中。

你可以试试我在这里描述的 docker 容器：***.com/a/33202985/2161065

【参考方案1】：

向 CRAN 提交一个包仍然让我感到不安，尽管在很多情况下都取得了成功。

需要检查的一些事项：

确保您使用的是正确的流程

具体来说，使用：

R CMD build pkg
R CMD check pkg_version.tar.gz

确保使用当前版本的 R 以及开发分支 R-devel (http://cran.r-project.org/bin/windows/base/rdevel.html) 进行检查

将你的包提交给 windows builder (http://win-builder.r-project.org/)

确保您已阅读并完全理解 CRAN 提交政策的每一句话 (http://cran.r-project.org/web/packages/policies.html)

使用在线提交表单 (http://cran.r-project.org/submit.html) 提交您的包裹

然后希望最好的。

说实话，我在 CRAN 构建团队中遇到的每个个人都非常耐心和乐于助人。

【讨论】：

感谢 Andrie 编辑我的帖子并提供可靠的答案。我将按照您的建议检查包含 R 的当前版本和开发版本的软件包。

然而，我遇到的问题源于包装的随机性。 Ripley 教授发现了一个合理的错误，我最终通过足够的复制设法重新创建了该错误。为了使小插图构建在未来的迭代中稳定，我选择使用 set.seed() 以便用户获得与小插图相同的结果，并且奇怪的错误不会在那个阶段出现（这可能会浪费 CRAN 核心团队时间）。