Linux下fsl安装
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Linux下fsl安装相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
参考技术A 1. 打开FSL官网 http://neuro.debian.net/install_pkg.html?p=fsl-complete对应如下界面,请选择自己的
1) 操作系统比如Ubuntu 18
2)国内源如清华源(3个China的都可以)
3) Only software
2. 在终端输入命令
wget -O-http://neuro.debian.net/lists/bionic.cn-bj1.libre | sudo tee/etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list
注意:有些博主反应这里会卡顿,可以耐心等一会儿或者按enter键。
3. 在终端输入命令
sudoapt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://pool.sks keyservers.net:800xA5D32F012649A5A9
4. Update
在终端输入命令sudo apt-get update
5. 安装FSL
注意上面步骤完全都是根据FSL官网上的提示来的
安装FSL 官网给的命令是sudo apt-get install fsl-complete
但我用这个命令老提示找不到对应安装包 所以更改为sudo apt-get install fsl
6. 配置环境变量
终端输入命令gedit /etc/bash.bashrc
然后在打开的/etc/bash.bashrc文件最后加上. /etc/fsl/fsl.sh
注意:1)有些博主提供的文件位置为etc/fsl,但我的是/etc/bash.bashrc(如上图)
2)我在打开之后文件为read-only不能编辑,解决方法是采用chmod命令修改文件读写权限
sudo chmod 777 /etc/bash.bashrc #每个用户都有读和写以及执行的权限
sudo chmod a+rw /etc/bash.bashrc #每个用户都有读写的权限
上面两个命令均可
执行后再用gedit /etc/bash.bashrc打开,不再出现read-only
修改完之后保存文件,环境变量配置成功。
7. 打开fsl
关闭终端后再次打开,输入fsl即可看到
arm-fsl-linux-gnueabi交叉编译器安装
系统:Ubuntu 14.04 64bit
编译器gcc version 4.4.4 (4.4.4_09.06.2010)
解压编译器到相应路径(注:当我解压放到/home/cross_compile/fsl/路径下时不能找到libc.so.6,而其实32位库的libc已经在ld.so.conf内声明路径了)
/opt/XXX
配置环境变量
[email protected]:~$ vi ~/.bashrc
在该文件添加以下两行:
FSL="/opt/arm-fsl-linux-gnueabi"
export PATH=$PATH:$FSL/bin
[email protected]:~$ source ~/.bashrc
测试
[email protected]:~$ arm-fsl-linux-gnueabi-gcc
报出no such file or directory的错误,据我经验是可执行文件elf(xxx-gcc)找不到与其相应位数的ld库,如果有ld库就不会只报着这么让人误会的问题了。
安装32位环境
Ubuntu13.xx及以后ia32-libs被替代了,不用鸟网上教材,大多不行了,直接跟着终端的提示
可是下列软件包取代了它: lib32z1 lib32ncurses5 lib32bz2-1.0
sudo api-get install lib32z1 lib32ncurses5 lib32bz2-1.0
基本就好了,还有报错自己网上找。
以上是关于Linux下fsl安装的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
脑影像分析工具保姆级安装教程——VMware Workstation16.1.2中安装FSL6.0.3/FSL6.0.4MRtrix3MRIcron并修复fsleyes not found