bcftools合并vcf文件

Posted chenwenyan

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了bcftools合并vcf文件相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

见命令:

bcftools merge A.vcf.gz B.vcf.gz C.vcf.gz -Oz -o ABC.vcf.gz

  参考链接:http://vcftools.sourceforge.net/htslib.html#merge

以上是关于bcftools合并vcf文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

bcftools 处理vcf文件,寻找多个vcf文件中突变的交集

bcftools常用命令总结

bcftools将vcf生成bgzip和index格式

python vcf2tsv - 脚本生成一个bcftools调用,该调用将输出VCF中所有可用的INFO和FORMAT列。

无法使用conda安装bcftools-gtc2vcf-plugin

pysam - 多种格式基因组数据(sam/bam/vcf/bcf/cram/…)读写与处理模块(python)