bcftools将vcf生成bgzip和index格式
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利用bcftools软件将vcf格式生成gz格式和index格式,需要用到“-Oz”和“index”命令,具体如下:
/bcftools-1.8/bin/bcftools view ExAC.vcf -Oz -o ExAC.vcf.gz /bcftools-1.8/bin/bcftools index ExAC.vcf.gz
以上是关于bcftools将vcf生成bgzip和index格式的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
python vcf2tsv - 脚本生成一个bcftools调用,该调用将输出VCF中所有可用的INFO和FORMAT列。