转录组pca图怎么看

Posted 2023-02-24

参考技术A

方法：提取大数据的主要特征分量，又称为主成分分析。

每一个检测到的基因都有一个表达量数值（FPKM/RPKM/TPM），所有基因的表达量都在二维空间中转化为一组向量，假设我们此次检测到一万个基因，那理论上全部数据的空间分布可能涉及到一万个维度，根据我们的降维思路，n维空间中的n个点一定能在一个k(k<n)维空间中分析，我们就可以通过线性变换将高维数据最终压缩到第一、第二特征分量所在的二维平面上。涉及到了PCA的降维思想。