数据库查找启动子区域并进行转录因子预测
Posted 生物点子王
tags:
篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了数据库查找启动子区域并进行转录因子预测相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
1. 查找启动子序列
http://bbs.pcbeta.com/viewthread-1314002-1-1.html
搜索目的基因,点击进入,下拉找到Sequence Retrieval Tool
2. 根据启动子序列进行转录因子预测
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB/#!/
工具栏找到Predict TFBS,点击进入,输入刚才下载好的启动子区域序列后提交,即可下载结果。
以上是关于数据库查找启动子区域并进行转录因子预测的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
python 鉴定H3k27ac峰,其与所有BLUEPRINT数据集中的启动子重叠并随后鉴定转录因子
易基因:全基因组ChIP-seq分析揭示细菌转录因子PhoB的基因内结合位点|mBio