序列比对及BAM、SAM文件
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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了序列比对及BAM、SAM文件相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
参考技术A 序列比对后的文件存在SAM文件中，序列比对软件有bwa等。一般我们现在不保存SAM文件，而是直接在bwa比对完之后用samtools生成BAM文件
什么叫BAM文件呢，他其实就是SAM文件的二进制文件（Binary SAM），大小只有SAM文件的大约25%，但是不像SAM文件是txt file，BAM文件是无法用txt方式打开的。也就说BAM就是序列比对后的文件用于之后的分析。
.bai = BAM index
以上是关于序列比对及BAM、SAM文件的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章