具有顺序约束的 LS 回归
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【中文标题】具有顺序约束的 LS 回归【英文标题】:LS regression with order constraint 【发布时间】:2017-02-26 14:08:03 【问题描述】:我是 R 新手,非常感谢您的帮助。 我有一个约束的优化问题。尽管有多种方法可以解决 R 中的优化问题,但我无法使用需要应用的约束正确表达我的问题。
假设我有以下三类数据:
A<-c(99.1, 96.5, 94.4, 92.7, 91.5, 91.3, 91.4, 90.1, 87.1, 82.6, 76.4)
B<-c(146.4, 140.2, 133.6, 126.5, 118.7, 109.4, 101.2, 101.8, 103.7, 102.5, 98.3)
C<-c(237.5, 213.9, 191, 168.9, 147.4, 124.9, 108.3, 95.7, 84.4, 73.5, 63)
t<-seq(1:11)
DT<-cbind.data.frame(t,A,B,C)
我想将指数函数 y(t) 拟合到每个类别中的数据点(最小化平方误差),以便 y(t)_c > y( t)_b > y(t)_a > 0 代表选定的 t [1;15]
【问题讨论】:
【参考方案1】:我不会尝试将约束合并到回归中。 只需构建三个独立的回归:
fit_loga <- lm(y ~ log(A) + t, data=DT)
fit_logb <- lm(y ~ log(B) + t, data=DT)
fit_logc <- lm(y ~ log(C) + t, data=DT)
fit_a <- exp(A)
fit_b <- exp(B)
fit_c <- exp(C)
然后验证它们是否满足该范围(或至少在每个整数数据点)上的约束:(fit_c > fit_b) & (fit_b > fit_a)
。只有没有,我们才会担心。比如把 t 中的一些其他术语加入到模型中,可能是exp(t)
、I(t^2)
、poly(t, <order>)
...
编辑:我不知道solnp
包。
【讨论】:
感谢您的回复 smci!我想像你建议的那样分两步完成它,但是在这种情况下,当 C 明显与 B 和 A 相交时,你会怎么做呢?恐怕我需要对所有曲线保持相同的曲线形式假设(这里:指数)。因此,一个参数会影响另一个参数,这需要同时对它们进行优化。我完全同意您应该在对数空间中寻找线性曲线的参数,而不是尝试拟合指数曲线。 哦,废话。好吧,如果它们相交,那么我们如何应用该约束?不用做一些笨拙的事情,比如使用 min/max 进行夹紧? 我认为这个问题可以通过像 solnp() 这样可以处理不等式约束的优化函数来解决。但是,当直接应用于最小化给定约束的平方误差时,它不会收敛或导致不可行的解决方案 @Walle:我不知道solnp
。建议您将代码和不可行的错误添加到问题详细信息和标题中。此外,这将在CrossValidated.SE
原来是solnp()
的格式问题,因为该函数需要估计所有参数,作为单个向量的输入。因此,我必须将必须的矩阵转换为向量并且它起作用了。从运行该函数时收到的错误消息中并不清楚,即non-numeric argument to binary operator
用于不可行的约束(太紧)。不知道我是应该发布代码还是关闭这个主题。【参考方案2】:
我认为使用solnp
得到的错误消息主要是指约束不足。此外,正如文档中所述,需要将所有参数放在一个向量中。在对代码进行适当调整后,我能够直接实现y(t)_c > y(t)_b > y(t)_a > 0
的约束,而无需更改问题。最方便的方法是对求解器使用矩阵形式。
使用上面的数据,我得到以下信息:
Results shown here
library(data.table)
library(Rsolnp)
t<-as.vector(10:20)
DT<-cbind.data.frame(A,B,C)
tlogDT<-transpose(log(DT))
# min[log(y)'- Ax-b]
# Arr = [A1 A2 .. An b1 b2 .. bn]
gofn = function(arrin)
arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
sum(
(as.matrix(arr[,1])%*%t + arr[,2] - tlogDT)^2
)
nocross=t #defines the times where the curves are not allowed to intersect
ineqfn2=function(arrin)
#constrains:
# 0<f_a(t)<f_b(t)<f_c(t), for some t,
arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
nextarr=as.matrix(rbind(rep(0,2),arr[1:(length(arr[,1])-1),]))
ineqmat=as.matrix(arr[,1])%*%nocross+arr[,2]-nextarr[,1]%*%nocross-nextarr[,2]
as.vector(t(ineqmat))
#lines should be aligned with the first startvalue
eqfn = function(arrin)
arr = cbind(arrin[1:3],arrin[4:6])
arr[,1]*t[1]+arr[,2]-tlogDT[,1]
#start values:
An=c(1,1,1)
bn=tlogDT[,1]
vstart=c(An,bn)
r <- solnp(
vstart, gofn,
eqfun = eqfn, eqB= c(0,0,0),
ineqfun = ineqfn2,
ineqLB = rep(0,length(DT[1,])*length(nocross)),
ineqUB = rep(5000,length(DT[1,])*length(nocross))
)
r$pars[1]
line1 = exp(r$pars[4]+r$pars[1]*t)
line2 = exp(r$pars[5]+r$pars[2]*t)
line3 = exp(r$pars[6]+r$pars[3]*t)
plot(t, DT[,3],log = "y")
points(t, DT[,2],col="green")
points(t, DT[,1],col="blue")
lines(t, line1,lwd=2, col = "blue", xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
lines(t, line2,lwd=2, col = "green", xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
lines(t, line3,lwd=2, col = "black", xlab = "Time (s)", ylab = "Counts")
【讨论】:
以上是关于具有顺序约束的 LS 回归的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
在具有线性回归的 data.table 上使用 Predict