利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

转自 https://www.plob.org/article/4603.html

具体请去上面的网页查看。

 

my $DNA="ATGCCCGGT";
my $pep=&TranslateDNASeq($DNA);

sub TranslateDNASeq{
    use Bio::Seq;
    (my $dna)[email protected]_;
    my $seqobj=Bio::Seq->new(-seq =>$dna, -alphabet =>‘dna‘);
    return $seqobj->translate()->seq();
}

 

以上是关于利用BioPerl将DNA序列翻译成蛋白序列的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

哪位好心人能帮我把这段DNA序列转变成蛋白质序列?

有哪位知道专门翻译dna互补链的网站?

有没有输入碱基能预测蛋白质三级结构的软件或网站

有一段长度约为1000bp的DNA序列,如何证明其中的PRD区(大约第60-100bp)表达的蛋白与特定蛋白有作用?

diamond & blast:DNA蛋白序列比对

blast 抗性筛选 啥意思