哪位好心人能帮我把这段DNA序列转变成蛋白质序列？

Posted 2023-02-20

DNA序列如下：TCACGCGTCGAATCGCGCGGCGACTCGATGAAATGGCCCGCGACGACGTCCCAATCCGCTTCCGCGCGCAGATCGGTGGTCTGCGCGGGCCAATGCTCGCGCGCTCGCGCGACGAACGCGGTGCGATAGGCCCAGCGCCGCGCGGGCAGGAGGTCGCCGTTGTGCGCGGCGACGAGGACACCCTCATCCGGACGCAGCGCGAGGATATCGGCCGTGCGCAGGTACGCTTCGGGCGTCGGCTTGTACGCCTGCGCCACCGTCGCGCCGAGGATCGCGTCCCACGGCAGCCAACGGCGCTTGGCCATGTCGATCATCAGGATCACGTTGCCGTTCGACAGCGGCGCGATGATGTAATGCGCCTTCAGCCGCGTGAGCCCCGCGACCGAATCGGGCCACGGATCGAGCCGGTGCCATGCGGGTATCAGCGCGTCGAGATCGGCGTCGGCCACGCTCGTGCGATCGATGCCGAACGCGGGCAGCAGCGCGTCGAGATTCTCCCGATGCAGAAGGTCGAGCCGCGTGAACGGCCGGCGGCCGCTGATGCCCTCCTCCATCGCGGGCGAATAGCCCGCGCGCCACGCATCCGCGAACGCGGCCGGATCGGCTCCCGCGCCGCCGTACTTCGCGAGGAACGGCGTCGCGTCGCGAATGACGCCGGAACGCCAGTCGACCACGGTGCCGAACACGTCGAATACCAATGCCTTCACGCCAAGCGTCTGCAT
我用Primer Premier 5.0翻译过来的是：
SRVESRGDSMKWPATTSQSASARRSVVCAGQCSRARATNAVR-AQRRAGRRSPLCAATRTPSSGRSARISAVRRYASGVGLYACATVAPRIASHGSQRRLAMSIIRITLPFDSGAMM-CAFSRVSPATESGHGSSRCHAGISASRSASATLVRSMPNAGSSASRFSRCRRSSRVNGRRPLMPSSIAGE-PARHASANAAGSAPAPPYFARNGVASRMTPERQSTTVPNTSNTNAFTPSVC
中间出现一些短横线“-”，结果拿去分析就无法分析。这是为什么？
PS:翻译出来了偶会给加分。。。

参考技术A SRVESRGDSMKWPATTSQSASARRSVVCAGQCSRARATNAVR*AQRRAGRRSPLCAATRT
PSSGRSARISAVRRYASGVGLYACATVAPRIASHGSQRRLAMSIIRITLPFDSGAMM*CA
FSRVSPATESGHGSSRCHAGISASRSASATLVRSMPNAGSSASRFSRCRRSSRVNGRRPL
MPSSIAGE*PARHASANAAGSAPAPPYFARNGVASRMTPERQSTTVPNTSNTNAFTPSVC
X
这个是EMBOSS Transeq Results
“*”和你的“-”都代表终止子，当然分析不下去了。追问

原来那是终止子啊。。。但是，既然题目这么给了，应该能分析下去的呀。。。

参考技术B 依照第三个读码框翻译的结果是：
TRRIARRLDEMARDDVPIRFRAQIGGLRGPMLARSRDERGAIGPAPRGQEVAVVRGDEDTLIRTQREDIGRAQVRFGRRLVRLRHRRAEDRVPRQPTALGHVDHQDHVAVRQRRDDVMRLQPREPRDRIGPRIEPVPCGYQRVEIGVGHARAIDAERGQQRVEILPMQKVEPRERPAAADALLHRGRIARAPRIRERGRIGSRAAVLREERRRVANDAGTPVDHGAEHVEYQCLHAKRLH追问

请问您是通过怎样的途径翻译到的呀？

追答

我又其他软件啊。我用的geneious软件把所有6个编码框都翻译出来看的。

追问

BLAST了一下，不知道哪出了差错，按道理应该能找到10个相似序列的，我只找到了三条

追答

你的DNA序列是测序数据么？里面包含完整的ＯＲＦ还是非完整的ＯＲＦ？

追问

其实，偶是小白。。。
我是在做一道题目，它给了那个DNA序列，要求检索与该蛋白序列相似的蛋白质序列并对它们进行多序列比对，构建该蛋白在原核生物中的分子进化系统树。。。

追答

我觉得你先得把我的问题搞清楚...问问给你序列的人是个什么情况吧。

追问

你的问题对偶来说还真有难度，呵呵……问老师估计他也不会说，毕竟是作业……我再看看吧

追答

或者你直接做blastp，用DNA序列直接找蛋白序列啊。

追问

在NCBI上找到了blastx、tblastn 、tblastx，木有找到blastp……T T

追答

哦，说错了，忘了你给的是DNA序列了。是用tblastn。bilastp是蛋白质查蛋白质的。

本回答被提问者采纳 参考技术C 自己答吧

参考资料：大爱