比对软件 - 总结

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了比对软件 - 总结相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

用过的比对软件不多,只知道简单的全局比对和局部比对算法,比对软件的原理基本是不知道的。

现在用过的比对软件:

bwa

bowtie

blasr

blast

blat

慢慢积累,比较这些软件的不同,因为生物信息最底层的就是比对,测序拿到一堆序列,第一件要做得事情就是比对。

先看一篇好文:Aligner tutorial: GMAP, STAR, BLAT, and BLASR

以上是关于比对软件 - 总结的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

35多重比对序列的格式及其应用

DNA/RNA序列比对软件整理

如何进行序列比对?如何进行序列拼接

MAFFT 进行多序列比对

BWA/BWT 比对软件

多序列比对并建树-ClustalW