Human Gene Functions（poj 1080）

Posted 2020-08-13 Cola

题目大意是：给定两组DNA序列，要你求出它们的最大相似度

每个字母与其他字母或自身和空格对应都有一个打分，求在这两个字符串中插入空格，让这两个字符串的匹配分数最大

/*
  思路是很好想的，设f[i][j]为A染色体前i个基因和B染色体前j个基因匹配的最大值
  第一次测样例WA了一把，f又没有赋最小值，今天第二次了，幸亏样例测出来了，不然又要WA一次。 
*/
#include<cstdio>
#include<iostream>
#include<cstring>
#define N 110
using namespace std;
int a[N],b[N],f[N][N],n,m;
int v[5][5]={{5,-1,-2,-1,-3},
             {-1,5,-3,-2,-4},
             {-2,-3,5,-2,-2},
             {-1,-2,-2,5,-1},
             {-3,-4,-2,-1,0}};
void work()
{
    scanf("%d",&n);
    for(int i=1;i<=n;i++)
    {
        char c;cin>>c;
        if(c==\'A\')a[i]=0;
        if(c==\'C\')a[i]=1;
        if(c==\'G\')a[i]=2;
        if(c==\'T\')a[i]=3;
    }
    scanf("%d",&m);
    for(int i=1;i<=m;i++)
    {
        char c;cin>>c;
        if(c==\'A\')b[i]=0;
        if(c==\'C\')b[i]=1;
        if(c==\'G\')b[i]=2;
        if(c==\'T\')b[i]=3;
    }
    f[0][0]=0;
    for(int i=0;i<=n;i++)
      for(int j=0;j<=m;j++)
      {
          if(i)f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j]+v[a[i]][4]);
          if(j)f[i][j]=max(f[i][j],f[i][j-1]+v[4][b[j]]);
          if(i&&j)f[i][j]=max(f[i][j],f[i-1][j-1]+v[a[i]][b[j]]);
      }
    printf("%d\\n",f[n][m]);
}
int main()
{
    freopen("jh.in","r",stdin);
    int T;scanf("%d",&T);
    while(T--)
    {
        memset(f,466,sizeof(f));
        work();
    }
    return 0;
}

View Code