如何对比两个基因外显子

Posted 2023-02-23

1、可以比较它们的序列，从而确定它们的相似性和差异性。可以做序列比对，对比两个外显子序列之间的相似度，然后比较它们的编码区域，以及外显子之间的编码氨基酸的相似性和差异性。
2、可以比较它们的结构，看它们的长度、起始点及终止点，以及它们的5’端和3’端。
3、可以比较它们的转录和翻译机制，看它们的剪接特征，以及各种转录因子及其结合位点的分布。
4、可以比较它们的功能，看它们是否具有类似的功能，或者是否有同源性或变异性，以及它们在特定细胞类型中的表达水平。 参考技术A 对比两个基因外显子可以使用系统发生学方法，如序列比对和树形比较。首先，将两个基因外显子的DNA序列进行比对，找出它们之间的相似和不同之处，然后利用这些信息构建一棵进化树，以便进一步深入了解两个基因外显子间的差异。 参考技术B 1、首先输入基因的完整学名,找到与基因相关的cDNA序列.在这一cRNA序列的解说信息里,就已经有各外显子的分节.
2、将该cDNA输入Blast进行序列比对,就可以找到其每一个外显子所对应的染色体位置,这些信息就显示了所有的外显子.处于外显子两端的序列就是内含子.
3、如你需要完整的基因序列,需要在blast中选择others这个数据库,然后查找相关的Bac质粒中含有你完整基因的文件,在其中找到你所需的信息.