将某一多行的fasta文件转换为单行的fasta文件

Posted 2023-03-14

参考技术A 处理数据的时候经常遇到将多行fasta转换为单行，或者将很多行fasta串联起来合并为一行，下面是一些方法。

1、将多行fasta转换为单行的，并保留原来的头

ps printf和print的区别：
printf不换行 print换行

2、将多行fasta文件转为单行，只保留一个头

3、写成一个小脚本

运行演示

部分内容参考自
https://stackoverflow.com/questions/15857088/remove-line-breaks-in-a-fasta-file
https://unix.stackexchange.com/questions/193246/how-can-i-detect-that-not-enough-options-were-passed-with-getopts