perl处理fasta文件

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了perl处理fasta文件相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

参考技术A

在perl处理fasta文件是,需要每次读入一个完整的 序列头+序列 ,需要利用到

将perl默认的行分隔符切换为">"。

且从文件中第一次读取的内容为">"号,可以在<IN>进行去除,IN为定义的输入句柄。
在处理数据时:

即可将一个序列的名保存到 $name 变量,将序列信息保留到 $seq 变量。

以上是关于perl处理fasta文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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