R包 clusterProfiler: GO和KEGG富集结果显示基因symbol
Posted
tags:
篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了R包 clusterProfiler: GO和KEGG富集结果显示基因symbol相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
参考技术A 注:1)MF和CC方法同BP,将BP改为MF,CC即可。2)可视化中,showCategory为显示的item数,scale_y_discrete则调节label过长的情况,让图片看起来
更美观。
3)检查结果,可见geneID展示为gene symbol。
(1)在enrichGO函数中,设置readable = TRUE;
(2)用setReadable函数,对GO或者KEGG结果进行转化即可。
以上是关于R包 clusterProfiler: GO和KEGG富集结果显示基因symbol的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
R获取指定GO term和KEGG pathway的gene list基因集