怎样打开BED格式文件

Posted 2023-04-12

BED 文件格式是一个可变方式的数据线，用来描述注释的数据。建议用plink转换为.map和.ped格式，其中ped文件中的数据就是想要的。用EditPlus打开即可。或者用excel可以打开。
BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。
首先是三个要求的BED字段：
1.chrom, 染色体或scafflold 的名字(eg chr3， chrY, chr2_random, scaffold0671 ).
2.chromStart 染色体和scaffold的起始位置，第一个染色体的位置是0.

3.chromEn 染色体和scaffold的结束位置，染色体的末端位置没有包含到显示信息里面。例如，首先得100个碱基的染色体定义为chromStart =0 . chromEnd=100, 碱基的数目是0-99

9 个额外的可选BED 字段是:
1. name 定义BED 的名字
2. score 0到1000的分值，如果track线在注释时属性设置为1，那么这个分值会决定现示灰度水平，数字越大，灰度越高。下面的这个表格显示Genome Browser
3. strand 定义链的''+” 或者”-”
4. thickStart 开始的位置，这个特征是画thickly(例如，在开始的编码显示基因的显示
5. thickEnd 结束的位置，这个特征是画thickly例如，在结束的编码显示基因的显示　
6. itemRGB An AGB 值的形式, R, G, B (eg. 255, 0, 0), 如果track line itemRgb属性是设置为'On”, 这个RBG 值将决定数据的显示的颜色在BED 线。 注意，它推荐简单的颜色方案(eight color or less )是用作这个属性避免颜色资源在基因组浏览器上过多

7. blockCount BED线在exon 的block数目

8. blockSize 用逗号分割block size, 这个item的列表对应于BlockCount

9. blockStarts- 用逗号分割的列表, 所有的blockStart位置应该被计算相关于chromStart, 这个数字的项应该对应于blockCount 参考技术A BED 文件格式是一个可变方式的数据线，用来描述注释的数据。BED线有3个要求的字段和9个额外的字段。每条线的字段数目必须是任意单条数据的在注释上一致。可选字段的序试结合低数字的字段必须流行如果高位字段被使用。

首先是三个要求的BED字段

chrom, 染色体或scafflold 的名字(eg chr3， chrY, chr2_random, scaffold0671 )

chromStart 染色体和scaffold的起始位置，第一个染色体的位置是0

chromEn 染色体和scaffold的结束位置，染色体的末端位置没有包含到显示信息里面。例如，首先得100个碱基的染色体定义为chromStart =0 . chromEnd=100, 碱基的数目是0-99

9 个额外的可选BED 字段是:

　 4. name 定义BED 的名字

5. score 0到1000的分值，如果track线在注释时属性设置为1，那么这个分值会决定现示灰度水平，数字

越大，灰度越高。下面的这个表格显示Genome Browser

6. strand 定义链的''+” 或者”-”

7. thickStart 开始的位置，这个特征是画thickly(例如，在开始的编码显示基因的显示

　 8. thickEnd 结束的位置，这个特征是画thickly例如，在结束的编码显示基因的显示　

　 9 itemRGB An AGB 值的形式, R, G, B (eg. 255, 0, 0), 如果track line itemRgb属性是设置为'On”, 这个RBG 值将

决定数据的显示的颜色在BED 线。　注意，　它推荐简单的颜色方案(eight color or less )是用作这个属性

避免颜色资源在基因组浏览器上过多

blockCount BED线在exon 的block数目

blockSize 用逗号分割block size, 这个item的列表对应于BlockCount

blockStarts- 用逗号分割的列表, 所有的blockStart位置应该被计算相关于chromStart, 这个数字的项应该对应于blockCount..本回答被提问者采纳 参考技术B 可以用excel直接打开来查看里面的信息……

怎样可将后缀为drw转换成dwg格式

别人发给我一个DRW格式的文件，请教如何将其转换成DEG或DXF格式，急需知道答案。

参考技术A File（文件）——save a copy（另存为），然后选择要保存的文件类型，选择dwg格式即可 参考技术B 下载个转换器
就在百度上搜
多死了
你还问这么多？》本回答被提问者采纳