测序fq文件的Q20是啥意思

Posted 2023-04-03

Q20值是指的测序过程碱基识别（Base Calling）过程中，对所识别的碱基给出的错误概率。

如果质量值是Q20，则错误识别的概率是1%，即错误率1%，或者正确率是99%；

如果质量值是Q30，则错误识别的概率是0.1%，即错误率0.1%，或者正确率是99.9%；

如果质量值是Q40，则错误识别的概率是0.01%，即错误率0.01%，或者正确率是99.99%；

你发现规律没有，Q“N”0的质量值，就是正确率有N个9的百分比，这样就非常容易记忆了。 参考技术A Q20一般是指测序质量大于等于20的碱基。对应错误率是0.01。 参考技术B 这个Q20是在结果的哪一行？

生物信息里PE reads是啥意思？

呃我是小白，麻烦大神给具体解释下，比如用什么软件之类的

PE reads 就是 paired-end reads。
reads（读长）是高通量测序中一个反应获得的测序序列。
在测序过程中，一条DNA分子的两端都可以测序。先测其中的一端，获得一个reads，然后再转到另一端测序，获得另外一个reads。得到的这两个reads就是PE reads。
PE reads 的获得有助于后期序列组装。 参考技术A 这是个生物基因测序里的软件