有效地计算组合和排列

Posted

技术标签:

【中文标题】有效地计算组合和排列【英文标题】:counting combinations and permutations efficiently 【发布时间】:2011-01-06 23:35:30 【问题描述】:

我有一些代码来计算排列和组合,我正在努力让它更好地处理大数。

我找到了一种更好的置换算法,可以避免大量中间结果,但我仍然认为我可以在组合方面做得更好。

到目前为止,我已经放入了一个特殊情况来反映 nCr 的对称性,但我仍然想找到一个更好的算法来避免调用 factorial(r),这是一个不必要的大中间结果。如果没有这种优化,最后一个 doctest 会花费很长时间来计算阶乘 (99000)。

谁能建议一种更有效的组合计数方法?

from math import factorial

def product(iterable):
    prod = 1
    for n in iterable:
        prod *= n
    return prod

def npr(n, r):
    """
    Calculate the number of ordered permutations of r items taken from a
    population of size n.

    >>> npr(3, 2)
    6
    >>> npr(100, 20)
    1303995018204712451095685346159820800000
    """
    assert 0 <= r <= n
    return product(range(n - r + 1, n + 1))

def ncr(n, r):
    """
    Calculate the number of unordered combinations of r items taken from a
    population of size n.

    >>> ncr(3, 2)
    3
    >>> ncr(100, 20)
    535983370403809682970
    >>> ncr(100000, 1000) == ncr(100000, 99000)
    True
    """
    assert 0 <= r <= n
    if r > n // 2:
        r = n - r
    return npr(n, r) // factorial(r)

【问题讨论】:

很久以前就有人问过这个问题,但无论如何...我设计了一个计算 C(n, m) = n 的算法! / (m! (n-m)!) 只要结果适合整数(很容易成为长整数)。我是用 Java 编写的,但应该很容易将其翻译成 Python 或任何其他程序语言:***.com/questions/50292530/…(查找 combinations(int n, int m) 【参考方案1】:

如果 n 离 r 不远,那么使用组合的递归定义可能会更好,因为 xC0 == 1 你只会有几次迭代:

这里相关的递归定义是:

nCr = (n-1)C(r-1) * n/r

这可以很好地使用尾递归和以下列表进行计算:

[(n - r, 0), (n - r + 1, 1), (n - r + 2, 2), ..., (n - 1, r - 1), (n, r )]

izip(xrange(n - r + 1, n+1), xrange(1, r+1))izip(xrange(n - r + 1, n+1), xrange(1, r+1))当然很容易在 Python 中生成(我们省略了第一个条目,因为 nC0 = 1)请注意,这假设 r 也可以优化使用

现在我们只需要使用带有 reduce 的尾递归来应用递归步骤。我们从 1 开始,因为 nC0 为 1,然后将当前值与列表中的下一个条目相乘,如下所示。

from itertools import izip

reduce(lambda x, y: x * y[0] / y[1], izip(xrange(n - r + 1, n+1), xrange(1, r+1)), 1)

【讨论】:

对于单个 nCr 这更好,但是当您有多个 nCr(大约 N)时,动态编程方法更好,即使它有很长的设置时间,因为它不会t 除非必要,否则溢出到“bignum”中。【参考方案2】:

两个相当简单的建议:

    为避免溢出,请在日志空间中执行所有操作。使用 log(a * b) = log(a) + log(b) 和 log(a / b) = log(a) - log(b) 的事实。这使得处理非常大的阶乘变得容易:log(n! / m!) = log(n!) - log(m!) 等。

    使用 gamma 函数代替阶乘。您可以在scipy.stats.loggamma 中找到一个。这是一种比直接求和更有效的计算对数阶乘的方法。 loggamma(n) == log(factorial(n - 1)),类似地,gamma(n) == factorial(n - 1)

【讨论】:

在日志空间做事的好建议。不过,不确定您所说的“精确”是什么意思。使用 log-floats 不会导致大数舍入错误吗? @Gorgapor:我想更清楚的表述方式是:“避免溢出”。已编辑。 请注意,由于浮点数的精度有限,这不会给出准确的结果。 @starblue:但是你知道真正的答案必须是一个整数,所以如果你做类似 round(exp(logFactorial(n))) 的事情,它对于小 n 来说是精确的。对于大 n 它可能是不精确的,但除了(慢)任意精度之外的任何东西都将是完全错误的。 对于小 n 计算这个并不麻烦。关键是要对大 n 进行准确计算,而且我已经在使用任意精度,因为我使用的是 python longs。【参考方案3】:

scipy 中有一个尚未提及的函数:scipy.special.comb。根据您的 doctest 的一些快速计时结果,这似乎很有效(comb(100000, 1000, 1) == comb(100000, 99000, 1) 约为 0.004 秒)。

[虽然这个特定问题似乎与算法有关,但问题 is there a math ncr function in python 被标记为与此重复...]

【讨论】:

【参考方案4】:

如果您不需要纯 python 解决方案,gmpy2 可能会有所帮助(gmpy2.comb 非常快)。

【讨论】:

感谢您的参考,这是一个非常实用的解决方案。不过,这对我来说更像是一个学习项目,所以我对算法比实际结果更感兴趣。 对于那些在写完这个答案几年后得出这个答案的人,gmpy 现在被称为 gmpy2。【参考方案5】:
from scipy import misc
misc.comb(n, k)

应该允许你计算组合

【讨论】:

【参考方案6】:

如果您正在计算 N 选择 K(我认为您正在使用 ncr 进行操作),那么有一个动态编程解决方案可能会快很多。这将避免阶乘,而且您可以保留该表以供以后使用。

这是它的教学链接:

http://www.csc.liv.ac.uk/~ped/teachadmin/algor/dyprog.html

不过,抱歉,我不确定如何更好地解决您的第一个问题。

编辑:这是模型。有一些非常搞笑的错误,所以它当然可以经受更多的清理。

import sys
n = int(sys.argv[1])+2#100
k = int(sys.argv[2])+1#20
table = [[0]*(n+2)]*(n+2)

for i in range(1,n):
    table[i][i] = 1
for i in range(1,n):
    for j in range(1,n-i):
        x = i+j
        if j == 1: table[x][j] = 1
        else: table[x][j] = table[x-1][j-1] + table[x-1][j]

print table[n][k]

【讨论】:

据我所知,这个实现似乎是 O(n^2) 而我布置的尾递归是 O(n)。 似乎使用了不同的递归定义。这里n选k=n-1选k-1+n-1选k,而我用n选k=n-1选k-1 * n/k 确实如此。我将很快编辑这篇文章,以包含该算法的快速 Python 模型。你的速度明显更快。我会把我的帖子留在这里,以防 Gorgapor 有一些奇特的机器,其中乘法需要几个小时。 >.> 这可能是 O(N^2),但它会预先计算 nCr 的所有组合对,所以如果你要大量使用 nCr 和很多不同的值,这会更快,因为查找是O(1) 并且不太容易溢出。不过,对于一个值,O(N) 算法更好。【参考方案7】:

更有效的 nCr 解决方案 - 空间方面和精度方面。

保证中间值 (res) 始终为 int 且永远不会大于结果。空间复杂度为 O(1)(无列表、无拉链、无堆栈),时间复杂度为 O(r) - 正好是 r 次乘法和 r 次除法。

def ncr(n, r):
    r = min(r, n-r)
    if r == 0: return 1
    res = 1
    for k in range(1,r+1):
        res = res*(n-k+1)/k
    return res

【讨论】:

【参考方案8】:

如果您的问题不需要知道排列或组合的确切数量,那么您可以使用Stirling's approximation 作为阶乘。

这将导致这样的代码:

import math

def stirling(n):
    # http://en.wikipedia.org/wiki/Stirling%27s_approximation
    return math.sqrt(2*math.pi*n)*(n/math.e)**n

def npr(n,r):
    return (stirling(n)/stirling(n-r) if n>20 else
            math.factorial(n)/math.factorial(n-r))

def ncr(n,r):    
    return (stirling(n)/stirling(r)/stirling(n-r) if n>20 else
            math.factorial(n)/math.factorial(r)/math.factorial(n-r))

print(npr(3,2))
# 6
print(npr(100,20))
# 1.30426670868e+39
print(ncr(3,2))
# 3
print(ncr(100,20))
# 5.38333246453e+20

【讨论】:

阶乘的主要问题是结果的大小,而不是计算它的时间。此外,这里的结果值比浮点值准确表示的值要大得多。【参考方案9】:

3.7 之前的 Python:

def prod(items, start=1):
    for item in items:
        start *= item
    return start


def perm(n, k):
    if not 0 <= k <= n:
        raise ValueError(
            'Values must be non-negative and n >= k in perm(n, k)')
    else:
        return prod(range(n - k + 1, n + 1))


def comb(n, k):
    if not 0 <= k <= n:
        raise ValueError(
            'Values must be non-negative and n >= k in comb(n, k)')
    else:
        k = k if k < n - k else n - k
        return prod(range(n - k + 1, n + 1)) // math.factorial(k)

对于 Python 3.8+:

math.perm() math.comb()

有趣的是,一些手动实现的组合功能可能比math.comb()快:

def math_comb(n, k):
    return math.comb(n, k)


def comb_perm(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    return math.perm(n, k) // math.factorial(k)


def comb(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    return prod(range(n - k + 1, n + 1)) // math.factorial(k)


def comb_other(n, k):
    k = k if k > n - k else n - k
    return prod(range(n - k + 1, n + 1)) // math.factorial(k)


def comb_reduce(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    return functools.reduce(
        lambda x, y: x * y[0] // y[1],
        zip(range(n - k + 1, n + 1), range(1, k + 1)),
        1)


def comb_iter(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    result = 1
    for i in range(1, k + 1):
        result = result * (n - i + 1) // i
    return result


def comb_iterdiv(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    result = divider = 1
    for i in range(1, k + 1):
        result *= (n - i + 1)
        divider *= i
    return result // divider


def comb_fact(n, k):
    k = k if k < n - k else n - k
    return math.factorial(n) // math.factorial(n - k) // math.factorial(k)

所以实际上comb_perm()(用math.perm()math.factorial() 实现)实际上在大多数情况下都比math.comb() 快。

请注意,comb_reduce() 很慢,与@wich's answer 的方法基本相同,而同样相对较慢的comb_iter() 与@ZXX's answer 基本相同。

【讨论】:

【参考方案10】:
from numpy import prod

def nCr(n,r):
    numerator = range(n, max(n-r,r),-1)
    denominator = range(1, min(n-r,r) +1,1)
    return int(prod(numerator)/prod(denominator))

【讨论】:

【参考方案11】:

使用xrange() 而不是range() 会稍微加快速度,因为没有中间列表被创建、填充、迭代和销毁。另外,reduce()operator.mul

【讨论】:

对不起,我不清楚,我的代码是 python 3,而不是 python 2。python 3 中的范围与 python 2 中的 xrange 相同。【参考方案12】:

对于 N 选择 K,您可以使用帕斯卡三角形。基本上,您需要保留大小为 N 的数组来计算所有 N 选择 K 值。只需添加即可。

【讨论】:

这基本上是 Agor 建议的,但它会是 O(n^2)。由于现在使用乘法和除法实际上不再是问题,因此使用不同的递归关系可以使算法像我描述的那样 O(n)。【参考方案13】:

您可以输入两个整数并导入数学库以找到阶乘,然后应用 nCr 公式

import math
n,r=[int(_)for _ in raw_input().split()]
f=math.factorial
print f(n)/f(r)/f(n-r)

【讨论】:

以上是关于有效地计算组合和排列的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

如何直观地理解排列数和组合数

您将如何迭代地计算 0 到 N 的所有可能排列?

如何计算R中的组合和排列?

排列组合中的大括号怎么算

有效地计算两个向量之间的差异

Python排列组合的计算方法