层次聚类中使用不同链接的不同距离矩阵

Posted 2023-04-18

【中文标题】层次聚类中使用不同链接的不同距离矩阵

【英文标题】：Different Distance Matrix with Different Linkage used in Hierarchical Clustering

【发布时间】：2020-07-26 07:37:04

【问题描述】：

我们如何在R中使用不同的距离矩阵和链接方法快速得到层次聚类的结果？

【参考方案1】：

我得到了答案，我们可以编写自定义函数，用它可以在 R 中处理此类问题，并且在 python 中也可以稍​​作改动。

hierarchical_clust <- function(orig_data_frame,x1,x2,n)

 y= dist(orig_data_frame,method =x1)
 fit <- hclust(y,method=x2)
 groups <- cuttree(fit,n)
 clust_centers <- aggregate(orig_data_frame,list(groups),mean)



   

【讨论】：

将 x1 替换为您想尝试的距离。将 x2 替换为链接方法，将 n 替换为您要尝试的集群数