安装 Cairo R 包时出错

Posted 2023-02-16

【中文标题】安装 Cairo R 包时出错

【英文标题】：Error in Installing the Cairo R Package

【发布时间】：2012-08-10 00:13:36

【问题描述】：

我正在尝试在 Mac OS X 10.7.4 上的 R 开发版本中安装 Cairo 包，但遇到了无法解决的问题。

我已经使用自制软件（即brew install cairo）安装了 Cairo，并收到以下消息：

==> 注意事项 此公式仅适用于小桶，因此未符号链接到 /usr/local。

Mac OS X 已提供此程序并安装另一个版本 并行可能会导致各种麻烦。

Leopard 提供的 Cairo 太旧，无法链接新软件 反对。

通常不会对您造成任何后果。如果你建立你的 自己的软件，它需要这个公式，你需要添加它的库 & 包含构建变量的路径：

LDFLAGS  -L/usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/lib
CPPFLAGS -I/usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/include

考虑到上述信息，我尝试使用以下 R 命令从 R-Forge 安装 Cairo 包：

install.packages("Cairo", repos="http://www.rforge.net/", configure.args = c("CAIRO_LIBS=/usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/lib" , "CAIRO_CFLAGS=/usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/include/cairo"))

我收到以下错误：

检查 cairo.h 的可用性...否

正在检查 cairo.h 的存在...否

正在检查 cairo.h... 否

配置：错误：找不到 cairo.h！

请安装 cairo (http://www.cairographics.org/) 和/或设置

CAIRO_CFLAGS/LIBS 对应。错误：包“Cairo”的配置失败

我重复相同的命令，但没有 repos 参数（默认情况下，我使用 FHCRC 镜像），结果相同。

此时，问题似乎很明显：文件cairo.h 不存在。但后来我列出了include/cairo 目录中的文件。回复如下：

ls /usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/include/cairo

cairo-deprecated.h cairo-ft.h 开罗-ps.h cairo-script-interpreter.h 开罗-svg.h 开罗-xcb.h 开罗-xlib.h cairo-features.h 开罗-pdf.h cairo-quartz.h cairo-script.h 开罗-version.h cairo-xlib-xrender.h cairo.h

所以，我将Cairo 包的安装指向适当的位置，但错误仍然存​​在。我尝试过变体，例如CAIRO_CFLAGS=/usr/local/Cellar/cairo/1.12.2/include，但没有成功。

想法？非常感谢您提供的任何帮助。

如果有必要，这里是我的sessionInfo：

R 开发中（不稳定）（2012-08-08 r60208）平台：x86_64-apple-darwin11.4.0（64 位）

语言环境：[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

附加的基础包：[1] stats graphics grDevices utils 数据集方法库

其他附加软件包：[1] BiocInstaller_1.5.12

通过命名空间加载（未附加）：[1] tools_2.16.0

【问题讨论】：

这是在黑暗中的尝试，但在 Unix 平台上，我通常会将这种行为与没有针对 Cairo 的开发包联系起来。我不能在这个上代表 Mac，但是许多 *nix 包都有一个二进制包和一个包含所有源代码和包含的开发包。 cairo.h 可能在其中，而不是在您认为的包含目录中。该目录被称为“包含”的事实可能具有欺骗性。 :-Z

@RyanRosario - 我不完全确定问题出在哪里，但请参阅下面的答案。基本上，我们从头开始手动安装了所有必要的 C 库。

好！我注意到对于某些罕见的包 A，所有依赖项要么需要是二进制的，要么需要从源代码一起构建，这是不幸的。当您有另一个包 C 需要为包 A 提供不同版本的先决条件 B 时，这会很痛苦。

【参考方案1】：

我遇到了类似的 cairo 配置错误问题，并且我已经使用 homebrew 安装了 cairo。试试下面

brew install pkg-config

这解决了我的问题。

【参考方案2】：

我和一个同事只是通过忽略我上面输入的所有内容来解决问题。相反，我们从源代码手动安装了 Cairo 及其所有依赖项，从而绕过了 brew 或 port 等变体的使用。这就像一个魅力，所以我不完全确定上面有什么问题。

【参考方案3】：

在尝试了此处列出的所有内容后，我发现了这篇关于使用 brew 安装“完整 R 包”的博文：https://luispuerto.net/blog/2018/05/11/installing-r-with-homebrew-with-all-the-capabilities/

最终对我有用的是使用 cairo 显式构建 R（brew 的默认 R tap 使用 --without-cairo 并且简单地编辑 tap 并不能解决我的问题）。

在 macOS Catalina 10.15.6 下使用 R 4.0.2、cairo 1.16.0_3 对我来说就像一个魅力。