为 Linux 安装 R 包时出错

Posted 2023-03-07

【中文标题】为 Linux 安装 R 包时出错

【英文标题】：Error installing R package for Linux

【发布时间】：2016-12-19 20:52:00

【问题描述】：

我试图在 R 3.3 上安装一个名为“rgeos”的包，但是当我输入时

install.packages("rgeos")

但它返回了以下错误（其他包也会发生同样的情况，但不是所有包）：

> * installing *source* package ‘rgeos’ ...
** package ‘rgeos’ successfully unpacked and MD5 sums checked
configure: CC: gcc
configure: CXX: g++
configure: rgeos: 0.3-19
checking for /usr/bin/svnversion... no
configure: svn revision: 524
checking for geos-config... no
no
configure: error: geos-config not found or not executable.
ERROR: configuration failed for package ‘rgeos’
* removing ‘/home/kdg/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3/rgeos’
> 
> The downloaded source packages are in
>   ‘/tmp/Rtmpsa5pDo/downloaded_packages’ Warning message: In
> install.packages("rgeos") :   installation of package ‘rgeos’ had
> non-zero exit status

任何线索如何安装这个包？

【问题讨论】：

您是否安装了任何地理库？在我的系统上，我有 geos 和 geos-devel

谢谢@user20650 成功了！！

【参考方案1】：

似乎在 Linux 中运行 R 时需要安装一些构建工具。在本例中，在终端中：

sudo apt-get install libgeos-dev

然后再次尝试安装包。

hints from here

【讨论】：

如果你在 Centos 上，我建议你关注：***.com/questions/42097501/…

作为替代方案：sudo apt-get install libgeos++-dev

@SRhm，你是对的。升级到 R 3.5 后，要安装 rgeos，我还必须安装 ibgeos++-dev。谢谢

【参考方案2】：

我用以下方法解决了：

cd /opt
git clone https://github.com/libgeos/geos
cd geos
export CC='clang' && export CXX='clang++' && export OBJC='clang'
./autogen.sh
./configure
make
sudo -EH make install
R
install.packages('rgeos')

注意：export clang 对我来说很特别；我只是粘贴我的确切解决方案。