如何使用 .yml 文件更新现有的 Conda 环境

Posted 2023-02-14

【中文标题】如何使用 .yml 文件更新现有的 Conda 环境

【英文标题】：How to update an existing Conda environment with a .yml file

【发布时间】：2017-07-10 05:18:17

【问题描述】：

如何使用另一个 .yml 文件更新预先存在的 conda 环境。这在处理具有多个需求文件的项目时非常有用，例如 base.yml, local.yml, production.yml 等。

例如，下面是一个base.yml 文件，其中包含 conda-forge、conda 和 pip 包：

base.yml

name: myenv
channels:
  - conda-forge
dependencies:
  - django=1.10.5
  - pip:
    - django-crispy-forms==1.6.1

实际环境是通过以下方式创建的： conda env create -f base.yml.

稍后，需要将额外的包添加到base.yml。另一个文件，比如local.yml，需要导入这些更新。

之前的尝试包括：

使用导入定义创建local.yml 文件：

channels:

dependencies:
  - pip:
    - boto3==1.4.4
imports:
  - requirements/base. 

然后运行命令： conda install -f local.yml。

这不起作用。有什么想法吗？

【问题讨论】：

是否可以更新当前激活的环境？？我刚试过这个，但更新到了 yml 文件中命名的环境。

这可能对从头开始有用：conda env create -f ~/CoqGym/coq_gym.yml（请参阅：***.com/questions/54492671/…）

【参考方案1】：

尝试使用conda env update：

conda activate myenv
conda env update --file local.yml --prune

--prune 卸载从@​​987654327@ 中删除的依赖项，正如@Blink 在this answer 中指出的那样。

或者不需要激活环境（感谢@NumesSanguis）：

conda env update --name myenv --file local.yml --prune

请参阅 Conda 用户指南中的 Updating an environment。

【讨论】：

-f 和 file.yml 之间不需要等号。删除等号将使制表符完成在.yml 文件名上工作。

添加--name env_name 以忽略local.yml 中的任何name: foo 标签。还可以防止需要先激活 myenv。完整命令：conda env update --name env_name --file local.yml 来自：***.com/a/45525593/3399066 的评论

在最新的 conda 版本中，我认为我们使用“conda activate myenv”而不是“source activate myenv”

有什么办法，我们可以传递一个参数，这个命令将只更新 .yml 文件中的可用库，这将确保当列出的任何库不可用时不会引发错误？

确保 YAML 文件没有 name 参数，否则它会使用此 update 命令创建

【参考方案2】：

建议的答案部分正确。您还需要添加 --prune 选项来卸载从 environment.yml 中删除的软件包。 正确的命令：

conda env update -f local.yml --prune

【讨论】：

即使是 --prune 标志也不足以删除 pip 安装的依赖项...

是的。我认为它将删除 conda 依赖项，但不会删除 pip 下列出的依赖项

有什么办法，我们可以传递一个参数，这个命令将只更新 .yml 文件中的可用库，这将确保当列出的任何库不可用时不会引发错误？

如果我的requirements.yml文件顶部有name:会有问题吗？

【参考方案3】：

alkamid 的答案是正确的，但我发现如果环境已经处于活动状态，Conda 无法安装新的依赖项。首先停用环境可以解决此问题：

source deactivate;
conda env update -f whatever.yml;
source activate my_environment_name; # Must be AFTER the conda env update line!

【讨论】：

如果不是当前活动的环境，conda 如何知道要更新哪个环境？

@ThomasFauskanger 您可以使用-n <environment name> 明确指定它，但默认情况下它似乎适用于预期环境（可能是最近活动的，或者只是默认环境选择）

@ThomasFauskanger 如果环境的名称已被 conda 导出，则在 YAML 文件中指定。

我认为这个问题的老观点是将不同的环境更新为 yaml 文件中指定的环境。

@ThomasFauskanger yaml 文件包含环境名称