如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning
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【中文标题】如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning【英文标题】:How to deal with SettingWithCopyWarning in Pandas 【发布时间】:2014-01-04 17:01:16 【问题描述】:背景
我刚刚将我的 Pandas 从 0.11 升级到 0.13.0rc1。现在,该应用程序弹出了许多新的警告。其中一个是这样的:
E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
我想知道它到底是什么意思?我需要改变什么吗?
如果我坚持使用quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
,我应该如何暂停警告?
产生错误的函数
def _decode_stock_quote(list_of_150_stk_str):
"""decode the webpage and return dataframe"""
from cStringIO import StringIO
str_of_all = "".join(list_of_150_stk_str)
quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype='A': object, 'B': object, 'C': np.float64
quote_df.rename(columns='A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime', inplace=True)
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
quote_df['TClose'] = quote_df['TPrice']
quote_df['RT'] = 100 * (quote_df['TPrice']/quote_df['TPCLOSE'] - 1)
quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
quote_df['TAmt'] = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
quote_df['STK_ID'] = quote_df['STK'].str.slice(13,19)
quote_df['STK_Name'] = quote_df['STK'].str.slice(21,30)#.decode('gb2312')
quote_df['TDate'] = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])
return quote_df
更多错误信息
E:\FinReporter\FM_EXT.py:449: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
quote_df['TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:450: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
quote_df['TAmt'] = quote_df['TAmt']/TAMT_SCALE
E:\FinReporter\FM_EXT.py:453: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
quote_df['TDate'] = quote_df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10])
【问题讨论】:
这里有一个上下文管理器来临时设置警告级别gist.github.com/notbanker/2be3ed34539c86e22ffdd88fd95ad8bc pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/…官方文档详解 @leonproudf.set_value
已被弃用。 Pandas 现在建议改用.at[]
或.iat[]
。文档在这里pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/…
使用df.loc[:, foo]
避免SettingWithCopyWarning
,而df[foo]
导致SettingWithCopyWarning
。
这能回答你的问题吗? Set value for particular cell in pandas DataFrame using index
【参考方案1】:
如何在 Pandas 中处理
SettingWithCopyWarning
?
这篇文章是为那些,
-
想了解此警告的含义
希望了解抑制此警告的不同方法
想了解如何改进他们的代码并遵循良好做法以避免将来出现此警告。
设置
np.random.seed(0)
df = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (3, 5)), columns=list('ABCDE'))
df
A B C D E
0 5 0 3 3 7
1 9 3 5 2 4
2 7 6 8 8 1
SettingWithCopyWarning
是什么?
要知道如何处理这个警告,首先要了解它的含义以及为什么会出现它。
过滤 DataFrame 时,可以对帧进行切片/索引以返回 view 或 copy,具体取决于内部布局和各种实现细节。正如术语所暗示的,“视图”是对原始数据的视图,因此修改视图可能会修改原始对象。另一方面,“副本”是对原始数据的复制,修改副本对原始数据没有影响。
正如其他答案所述,创建 SettingWithCopyWarning
是为了标记“链式分配”操作。在上面的设置中考虑df
。假设您想选择“B”列中的所有值,其中“A”列中的值大于 5。Pandas 允许您以不同的方式执行此操作,其中一些方式比其他方式更正确。例如,
df[df.A > 5]['B']
1 3
2 6
Name: B, dtype: int64
还有,
df.loc[df.A > 5, 'B']
1 3
2 6
Name: B, dtype: int64
这些返回相同的结果,因此如果您只读取这些值,则没有区别。那么,问题是什么?链式赋值的问题在于,通常很难预测返回的是视图还是副本,因此当您尝试将值重新赋值时,这很大程度上会成为一个问题。例如,考虑一下解释器如何执行这段代码:
df.loc[df.A > 5, 'B'] = 4
# becomes
df.__setitem__((df.A > 5, 'B'), 4)
通过单个__setitem__
调用df
。 OTOH,请考虑以下代码:
df[df.A > 5]['B'] = 4
# becomes
df.__getitem__(df.A > 5).__setitem__('B', 4)
现在,根据 __getitem__
是返回视图还是副本,__setitem__
操作可能不起作用。
一般来说,您应该使用loc
进行基于标签的分配,使用iloc
进行基于整数/位置的分配,因为规范保证它们始终在原始值上运行。此外,对于设置单个单元格,您应该使用at
和iat
。
更多信息请见documentation。
注意 使用
loc
完成的所有布尔索引操作也可以使用iloc
完成。唯一的区别是iloc
期望要么 索引的整数/位置或布尔值的numpy数组,以及 列的整数/位置索引。例如,
df.loc[df.A > 5, 'B'] = 4
可以写成nas
df.iloc[(df.A > 5).values, 1] = 4
还有,
df.loc[1, 'A'] = 100
可以写成
df.iloc[1, 0] = 100
等等。
告诉我如何取消警告!
考虑对df
的“A”列进行简单操作。选择“A”并除以 2 会引发警告,但该操作会起作用。
df2 = df[['A']]
df2['A'] /= 2
/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/IPython/__main__.py:1: SettingWithCopyWarning:
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead
df2
A
0 2.5
1 4.5
2 3.5
有几种方法可以直接消除此警告:
(推荐)使用loc
对子集进行切片:
df2 = df.loc[:, ['A']]
df2['A'] /= 2 # Does not raise
更改pd.options.mode.chained_assignment
可以设置为None
、"warn"
或"raise"
。 "warn"
是默认值。 None
将完全抑制警告,"raise"
将抛出 SettingWithCopyError
,阻止操作通过。
pd.options.mode.chained_assignment = None
df2['A'] /= 2
发deepcopy
df2 = df[['A']].copy(deep=True)
df2['A'] /= 2
@Peter Cotton 在 cmets 中提出了一种使用上下文管理器非侵入式更改模式(从this gist 修改)的好方法,仅在需要时设置模式,然后重置完成后恢复到原来的状态。
class ChainedAssignent: def __init__(self, chained=None): acceptable = [None, 'warn', 'raise'] assert chained in acceptable, "chained must be in " + str(acceptable) self.swcw = chained def __enter__(self): self.saved_swcw = pd.options.mode.chained_assignment pd.options.mode.chained_assignment = self.swcw return self def __exit__(self, *args): pd.options.mode.chained_assignment = self.saved_swcw
用法如下:
# some code here
with ChainedAssignent():
df2['A'] /= 2
# more code follows
或者,引发异常
with ChainedAssignent(chained='raise'):
df2['A'] /= 2
SettingWithCopyError:
A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_indexer,col_indexer] = value instead
“XY 问题”:我做错了什么?
很多时候,用户试图寻找抑制此异常的方法,但并未完全理解它最初出现的原因。这是XY problem 的一个很好的例子,用户试图解决一个问题“Y”,这实际上是一个根深蒂固的问题“X”的症状。将根据遇到此警告的常见问题提出问题,然后提出解决方案。
问题 1 我有一个数据框
df A B C D E 0 5 0 3 3 7 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1
我想将 col "A" > 5 中的值分配给 1000。我的预期输出是
A B C D E 0 5 0 3 3 7 1 1000 3 5 2 4 2 1000 6 8 8 1
错误的做法:
df.A[df.A > 5] = 1000 # works, because df.A returns a view
df[df.A > 5]['A'] = 1000 # does not work
df.loc[df.A > 5]['A'] = 1000 # does not work
使用loc
的正确方法:
df.loc[df.A > 5, 'A'] = 1000
问题 21 我正在尝试将单元格 (1, 'D') 中的值设置为 12345。我的预期输出是
A B C D E 0 5 0 3 3 7 1 9 3 5 12345 4 2 7 6 8 8 1
我尝试了不同的方法来访问这个单元格,例如
df['D'][1]
。最好的方法是什么?1。这个问题与警告没有特别的关系,但是 最好了解如何正确执行此特定操作 以避免可能出现警告的情况 未来。
您可以使用以下任何一种方法来做到这一点。
df.loc[1, 'D'] = 12345
df.iloc[1, 3] = 12345
df.at[1, 'D'] = 12345
df.iat[1, 3] = 12345
问题 3 我正在尝试根据某些条件对值进行子集化。我有一个 数据帧
A B C D E 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1
我想将“D”中的值分配给 123,使得“C”== 5。我 试过了
df2.loc[df2.C == 5, 'D'] = 123
这看起来不错,但我仍然得到了
SettingWithCopyWarning
!我该如何解决这个问题?
这实际上可能是因为管道中的代码较高。你是不是用更大的东西创建了df2
,比如
df2 = df[df.A > 5]
?在这种情况下,布尔索引将返回一个视图,因此df2
将引用原始视图。您需要做的是将df2
分配给副本:
df2 = df[df.A > 5].copy()
# Or,
# df2 = df.loc[df.A > 5, :]
问题 4 我正在尝试从
中删除列“C”
A B C D E 1 9 3 5 2 4 2 7 6 8 8 1
但是使用
df2.drop('C', axis=1, inplace=True)
抛出
SettingWithCopyWarning
。为什么会这样?
这是因为df2
必须是从其他切片操作创建的视图,例如
df2 = df[df.A > 5]
这里的解决方案是要么使用 df
的 copy()
,要么像以前一样使用 loc
。
【讨论】:
P.S.:如果您的情况不在第 3 节的问题列表中,请告诉我。我会修改我的帖子。 我认为将问题 2 链接到解决 loc、iloc、at 和 iat 之间差异的问题会很有帮助。您可能比我更了解这样的问题,但如果有帮助,我很乐意寻求。 This question 解决同时使用 loc 和 iloc 的情况,iloc 代表行,loc 代表列 @cs95:您能否在尝试基于现有列的简单数学运算创建新列的情况下添加 XY 描述。如 df['new_col'] = df['old_col']/2。 'new_col' 尚不存在的地方。谢谢 @BryanP 除非我弄错了,应该或多或少地包含在“告诉我如何抑制警告!”部分。【参考方案2】:为我工作:
import pandas as pd
# ...
pd.set_option('mode.chained_assignment', None)
【讨论】:
【参考方案3】:只需在警告出现之前使用.copy()
方法创建数据帧的副本,即可删除所有警告。发生这种情况是因为我们不想更改原始的 quote_df。换句话说,我们不想玩我们为 quote_df 创建的 quote_df 对象的引用。
quote_df = quote_df.copy()
【讨论】:
【参考方案4】:我在执行这部分代码时遇到了同样的警告:
def scaler(self, numericals):
scaler = MinMaxScaler()
self.data.loc[:, numericals[0]] = scaler.fit_transform(self.data.loc[:, numericals[0]])
self.data.loc[:, numericals[1]] = scaler.fit_transform(self.data.loc[:, numericals[1]])
scaler
是一个 MinMaxScaler,numericals[0]
包含我的 3 个数字列的名称。
当我将代码更改为:
def scaler(self, numericals):
scaler = MinMaxScaler()
self.data.loc[:][numericals[0]] = scaler.fit_transform(self.data.loc[:][numericals[0]])
self.data.loc[:][numericals[1]] = scaler.fit_transform(self.data.loc[:][numericals[1]])
所以,只需将 [:, ~]
更改为 [:][~]
【讨论】:
【参考方案5】:为了消除任何疑问,我的解决方案是制作切片的深层副本,而不是常规副本。 这可能不适用,具体取决于您的上下文(内存限制/切片的大小,性能下降的可能性 - 特别是如果复制发生在像我这样的循环中,等等......)
要清楚,这是我收到的警告:
/opt/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/ipykernel/__main__.py:54:
SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame
See the caveats in the documentation:
http://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/indexing.html#indexing-view-versus-copy
插图
我怀疑由于我在切片副本上放置了列而引发了警告。虽然技术上并没有尝试在切片副本中设置值,但这仍然是对切片副本的修改。 以下是我为确认怀疑而采取的(简化的)步骤,希望对我们这些试图理解警告的人有所帮助。
示例 1:在原件上删除一列会影响副本
我们已经知道了,但这是一个健康的提醒。这不是警告的内容。
>> data1 = 'A': [111, 112, 113], 'B':[121, 122, 123]
>> df1 = pd.DataFrame(data1)
>> df1
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
>> df2 = df1
>> df2
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
# Dropping a column on df1 affects df2
>> df1.drop('A', axis=1, inplace=True)
>> df2
B
0 121
1 122
2 123
可以避免对 df1 所做的更改影响 df2。注意:您可以通过使用 df.copy()
来避免导入 copy.deepcopy
。
>> data1 = 'A': [111, 112, 113], 'B':[121, 122, 123]
>> df1 = pd.DataFrame(data1)
>> df1
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
>> import copy
>> df2 = copy.deepcopy(df1)
>> df2
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
# Dropping a column on df1 does not affect df2
>> df1.drop('A', axis=1, inplace=True)
>> df2
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
示例 2:在副本上删除一列可能会影响原件
这实际上说明了警告。
>> data1 = 'A': [111, 112, 113], 'B':[121, 122, 123]
>> df1 = pd.DataFrame(data1)
>> df1
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
>> df2 = df1
>> df2
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
# Dropping a column on df2 can affect df1
# No slice involved here, but I believe the principle remains the same?
# Let me know if not
>> df2.drop('A', axis=1, inplace=True)
>> df1
B
0 121
1 122
2 123
可以避免对 df2 所做的更改影响 df1
>> data1 = 'A': [111, 112, 113], 'B':[121, 122, 123]
>> df1 = pd.DataFrame(data1)
>> df1
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
>> import copy
>> df2 = copy.deepcopy(df1)
>> df2
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
>> df2.drop('A', axis=1, inplace=True)
>> df1
A B
0 111 121
1 112 122
2 113 123
干杯!
【讨论】:
【参考方案6】:这个话题真的让 Pandas 很困惑。幸运的是,它有一个相对简单的解决方案。
问题在于,数据过滤操作(例如 loc)是否返回 DataFrame 的副本或视图并不总是很清楚。因此,进一步使用此类过滤后的 DataFrame 可能会造成混淆。
简单的解决方案是(除非您需要处理非常大的数据集):
每当您需要更新任何值时,请始终确保在分配之前明确复制 DataFrame。
df # Some DataFrame
df = df.loc[:, 0:2] # Some filtering (unsure whether a view or copy is returned)
df = df.copy() # Ensuring a copy is made
df[df["Name"] == "John"] = "Johny" # Assignment can be done now (no warning)
【讨论】:
对于大型数据集,您可以制作浅(深=假)副本。抑制警告似乎还是太过分了。【参考方案7】:创建SettingWithCopyWarning
是为了标记可能令人困惑的“链式”分配,例如以下,它并不总是按预期工作,特别是当第一个选择返回一个副本 时。 [有关背景讨论,请参阅 GH5390 和 GH5597。]
df[df['A'] > 2]['B'] = new_val # new_val not set in df
警告提供了如下重写的建议:
df.loc[df['A'] > 2, 'B'] = new_val
但是,这不适合你的用法,相当于:
df = df[df['A'] > 2]
df['B'] = new_val
虽然很明显您并不关心将其写入原始帧(因为您正在覆盖对它的引用),但不幸的是,这种模式无法与第一个链式分配示例区分开来。因此(误报)警告。如果您想进一步阅读,docs on indexing 中解决了误报的可能性。您可以通过以下分配安全地禁用此新警告。
import pandas as pd
pd.options.mode.chained_assignment = None # default='warn'
其他资源
pandas User Guide: Indexing and selecting data Python Data Science Handbook: Data Indexing and Selection Real Python: SettingWithCopyWarning in Pandas: Views vs Copies Dataquest: SettingwithCopyWarning: How to Fix This Warning in Pandas Towards Data Science: Explaining the SettingWithCopyWarning in pandas【讨论】:
我正在使用数据帧的一个切片,在该切片中进行修改并收到此错误。我通过在原始数据帧上执行.copy()
创建了这个切片,它起作用了。
df = df[df['A'].notnull()]
应该如何处理?【参考方案8】:
从我使用.query()
方法的预先存在的数据帧分配新数据帧时,我遇到了.apply()
的这个问题。例如:
prop_df = df.query('column == "value"')
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)
将返回此错误。在这种情况下似乎可以解决错误的修复方法是将其更改为:
prop_df = df.copy(deep=True)
prop_df = prop_df.query('column == "value"')
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)
但是,由于必须制作新副本,因此效率不高,尤其是在使用大型数据帧时。
如果您使用.apply()
方法生成新列及其值,解决错误且更有效的修复方法是添加.reset_index(drop=True)
:
prop_df = df.query('column == "value"').reset_index(drop=True)
prop_df['new_column'] = prop_df.apply(function, axis=1)
【讨论】:
【参考方案9】:由于这个问题已经在现有答案中得到充分解释和讨论,我将使用pandas.option_context
为上下文管理器提供一个简洁的pandas
方法(链接到docs 和example) - 绝对没有必要创建一个包含所有 dunder 方法和其他花里胡哨的自定义类。
首先是上下文管理器代码本身:
from contextlib import contextmanager
@contextmanager
def SuppressPandasWarning():
with pd.option_context("mode.chained_assignment", None):
yield
再举个例子:
import pandas as pd
from string import ascii_letters
a = pd.DataFrame("A": list(ascii_letters[0:4]), "B": range(0,4))
mask = a["A"].isin(["c", "d"])
# Even shallow copy below is enough to not raise the warning, but why is a mystery to me.
b = a.loc[mask] # .copy(deep=False)
# Raises the `SettingWithCopyWarning`
b["B"] = b["B"] * 2
# Does not!
with SuppressPandasWarning():
b["B"] = b["B"] * 2
值得注意的是,这两种方法都不会修改a
,这让我有点惊讶,即使是带有.copy(deep=False)
的浅层df 副本也会阻止引发此警告(据我所知,浅层副本应该至少也修改a
,但它没有。pandas
魔术。)。
【讨论】:
【参考方案10】:这里我直接回答问题。如何处理?
切片后创建.copy(deep=False)
。见pandas.DataFrame.copy。
等等,切片不是返回一个副本吗?毕竟,这就是警告信息想要表达的意思?阅读长答案:
import pandas as pd
df = pd.DataFrame('x':[1,2,3])
这给出了一个警告:
df0 = df[df.x>2]
df0['foo'] = 'bar'
这不是:
df1 = df[df.x>2].copy(deep=False)
df1['foo'] = 'bar'
df0
和 df1
都是 DataFrame
对象,但它们的某些方面有所不同,这使得 pandas 能够打印警告。让我们找出它是什么。
import inspect
slice= df[df.x>2]
slice_copy = df[df.x>2].copy(deep=False)
inspect.getmembers(slice)
inspect.getmembers(slice_copy)
使用您选择的差异工具,您会发现除了几个地址之外,唯一的实质性区别是:
| | slice | slice_copy |
| _is_copy | weakref | None |
决定是否发出警告的方法是DataFrame._check_setitem_copy
,它检查_is_copy
。所以给你。创建一个copy
,这样你的DataFrame就不是_is_copy
。
警告建议使用.loc
,但如果您在_is_copy
的框架上使用.loc
,您仍然会收到相同的警告。误导?是的。恼人的?你打赌。有帮助吗?潜在地,当使用链式赋值时。但它无法正确检测链分配并乱打印警告。
【讨论】:
很好的侦探。 FWIW 我还发现_is_copy
是 None
原始 df 和切片的弱引用。此外,切片上的_is_copy()
返回原始df 的所有行。但是_is_copy
打印的reference和原df的id不一样。切片是否以某种方式复制?另外,我想知道浅拷贝是否会导致其他问题或更新版本的熊猫?【参考方案11】:
有些人可能想简单地取消警告:
class SupressSettingWithCopyWarning:
def __enter__(self):
pd.options.mode.chained_assignment = None
def __exit__(self, *args):
pd.options.mode.chained_assignment = 'warn'
with SupressSettingWithCopyWarning():
#code that produces warning
【讨论】:
【参考方案12】:后续初学者问题/备注
也许对于像我这样的其他初学者来说是一个澄清(我来自 R,它在引擎盖下的工作似乎有点不同)。以下看起来无害且功能强大的代码不断产生 SettingWithCopy 警告,我不知道为什么。我已经阅读并理解了“链式索引”的发布,但我的代码不包含任何内容:
def plot(pdb, df, title, **kw):
df['target'] = (df['ogg'] + df['ugg']) / 2
# ...
但后来,太晚了,我查看了调用 plot() 函数的位置:
df = data[data['anz_emw'] > 0]
pixbuf = plot(pdb, df, title)
所以“df”不是数据框,而是一个对象,它以某种方式记住它是通过索引数据框创建的(所以那是一个视图吗?)这将在 plot() 中生成线条
df['target'] = ...
相当于
data[data['anz_emw'] > 0]['target'] = ...
这是一个链式索引。我说对了吗?
不管怎样,
def plot(pdb, df, title, **kw):
df.loc[:,'target'] = (df['ogg'] + df['ugg']) / 2
修复它。
【讨论】:
聚会有点晚了,但.loc
应该转到df = data[data['anz_emw'] > 0]
,而不是plot()
函数。
这个解释是唯一让我明白的(也许是因为我也来自 R)。谢谢!【参考方案13】:
Pandas 数据框复制警告
当你去做这样的事情时:
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
pandas.ix
在这种情况下返回一个新的独立数据框。
您决定在此数据框中更改的任何值都不会更改原始数据框。
这是 pandas 试图警告你的。
为什么.ix
是个坏主意
.ix
对象试图做的不止一件事,对于任何读过干净代码的人来说,这是一种强烈的气味。
鉴于此数据框:
df = pd.DataFrame("a": [1,2,3,4], "b": [1,1,2,2])
两种行为:
dfcopy = df.ix[:,["a"]]
dfcopy.a.ix[0] = 2
行为一:dfcopy
现在是一个独立的数据框。改了不会改df
df.ix[0, "a"] = 3
行为二:这会改变原始数据框。
改用.loc
pandas 开发人员认识到.ix
对象很臭[推测性地],因此创建了两个新对象来帮助访问和分配数据。 (另一个是.iloc
)
.loc
更快,因为它不会尝试创建数据的副本。
.loc
旨在就地修改您现有的数据帧,这样可以提高内存效率。
.loc
是可预测的,它有一个行为。
解决方案
您在代码示例中所做的是加载一个包含很多列的大文件,然后将其修改为更小。
pd.read_csv
函数可以帮助您解决很多问题,还可以加快文件的加载速度。
所以不要这样做
quote_df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype='A': object, 'B': object, 'C': np.float64
quote_df.rename(columns='A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime', inplace=True)
quote_df = quote_df.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
这样做
columns = ['STK', 'TPrice', 'TPCLOSE', 'TOpen', 'THigh', 'TLow', 'TVol', 'TAmt', 'TDate', 'TTime']
df = pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', usecols=[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31])
df.columns = columns
这只会读取您感兴趣的列,并正确命名它们。不需要使用邪恶的.ix
对象来做神奇的事情。
【讨论】:
【参考方案14】:一般来说,SettingWithCopyWarning
的目的是向用户(尤其是新用户)表明他们可能在操作副本而不是他们认为的原件。 有误报(如果你知道自己在做什么,IOW 可能是 ok)。一种可能性是像@Garrett 建议的那样简单地关闭(默认情况下warn)警告。
这是另一种选择:
In [1]: df = DataFrame(np.random.randn(5, 2), columns=list('AB'))
In [2]: dfa = df.ix[:, [1, 0]]
In [3]: dfa.is_copy
Out[3]: True
In [4]: dfa['A'] /= 2
/usr/local/bin/ipython:1: SettingWithCopyWarning: A value is trying to be set on a copy of a slice from a DataFrame.
Try using .loc[row_index,col_indexer] = value instead
#!/usr/local/bin/python
您可以将is_copy
标志设置为False
,这将有效地关闭检查,对该对象:
In [5]: dfa.is_copy = False
In [6]: dfa['A'] /= 2
如果您明确复制,则不会发生进一步的警告:
In [7]: dfa = df.ix[:, [1, 0]].copy()
In [8]: dfa['A'] /= 2
上面显示的 OP 代码虽然是合法的,而且我可能也会这样做,但从技术上讲,这是此警告的一个案例,而不是误报。 没有警告的另一种方法是通过reindex
进行选择操作,例如
quote_df = quote_df.reindex(columns=['STK', ...])
或者,
quote_df = quote_df.reindex(['STK', ...], axis=1) # v.0.21
【讨论】:
我认为说有误报是轻描淡写的。我认为我从来没有得到过这个警告帮助我,而且我让它阻塞我的输出的次数是疯狂的。这也是一种不好的编程习惯:如果你开始忽略输出中的警告,因为你知道它们是纯粹的垃圾,你可能会开始错过真正的问题。不得不一直关闭相同的警告也很烦人。【参考方案15】:这应该可行:
quote_df.loc[:,'TVol'] = quote_df['TVol']/TVOL_SCALE
【讨论】:
【参考方案16】:我相信你可以避免这样的整个问题:
return (
pd.read_csv(StringIO(str_of_all), sep=',', names=list('ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZabcdefg')) #dtype='A': object, 'B': object, 'C': np.float64
.rename(columns='A':'STK', 'B':'TOpen', 'C':'TPCLOSE', 'D':'TPrice', 'E':'THigh', 'F':'TLow', 'I':'TVol', 'J':'TAmt', 'e':'TDate', 'f':'TTime', inplace=True)
.ix[:,[0,3,2,1,4,5,8,9,30,31]]
.assign(
TClose=lambda df: df['TPrice'],
RT=lambda df: 100 * (df['TPrice']/quote_df['TPCLOSE'] - 1),
TVol=lambda df: df['TVol']/TVOL_SCALE,
TAmt=lambda df: df['TAmt']/TAMT_SCALE,
STK_ID=lambda df: df['STK'].str.slice(13,19),
STK_Name=lambda df: df['STK'].str.slice(21,30)#.decode('gb2312'),
TDate=lambda df: df.TDate.map(lambda x: x[0:4]+x[5:7]+x[8:10]),
)
)
使用分配。来自documentation:将新列分配给 DataFrame,返回一个新对象(副本),其中包含除新列之外的所有原始列。
请参阅 Tom Augspurger 关于 pandas 中的方法链接的文章:https://tomaugspurger.github.io/method-chaining
【讨论】:
【参考方案17】:对我来说,这个问题发生在以下 >simplified
带有警告的旧代码:
def update_old_dataframe(old_dataframe, new_dataframe):
for new_index, new_row in new_dataframe.iterrorws():
old_dataframe.loc[new_index] = update_row(old_dataframe.loc[new_index], new_row)
def update_row(old_row, new_row):
for field in [list_of_columns]:
# line with warning because of chain indexing old_dataframe[new_index][field]
old_row[field] = new_row[field]
return old_row
这打印了old_row[field] = new_row[field]
行的警告
由于 update_row 方法中的行实际上是 Series
类型,我将行替换为:
old_row.at[field] = new_row.at[field]
即method 用于访问/查找Series
。尽管两者都可以正常工作并且结果相同,但这样我就不必禁用警告(=为其他地方的其他链索引问题保留它们)。
我希望这可以帮助某人。
【讨论】:
【参考方案18】:如果您已将切片分配给变量并希望使用该变量进行设置,如下所示:
df2 = df[df['A'] > 2]
df2['B'] = value
并且您不想使用 Jeffs 解决方案,因为您的条件计算 df2
太长或出于其他原因,那么您可以使用以下内容:
df.loc[df2.index.tolist(), 'B'] = value
df2.index.tolist()
返回 df2 中所有条目的索引,然后将用于设置原始数据框中的 B 列。
【讨论】:
这比 df["B"] = value 贵 9 倍 你能更深入地解释一下@ClaudiuCreanga吗?以上是关于如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning
如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning
如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning
如何处理 Pandas 中的 SettingWithCopyWarning