如何使用 pip 从 Conda 安装软件包 rdkit？

Posted 2023-03-07

【中文标题】如何使用 pip 从 Conda 安装软件包 rdkit？

【英文标题】：How to install a package rdkit from Conda with pip?

【发布时间】：2020-01-31 14:44:38

【问题描述】：

我正在尝试使用 pip3 安装 rdkit。但它不起作用。

sudo pip3 install rdkit
Error:  Could not find a version that satisfies the requirement rdkit (from versions: )
No matching distribution found for rdkit

conda 显然只有一个选项

conda install -c rdkit rdkit

如何使用 pip 安装它？ 谢谢

【问题讨论】：

为什么不听从他们的建议呢？ rdkit.org/docs/Install.html#installation

【参考方案1】：

您目前无法使用 pip 安装 rdkit，无论是从源代码构建还是使用 anaconda 安装为 recommended。使用 pip 使 rdkit 可安装很棘手，请参阅 github issue

【参考方案2】：

在一两周前，您可以使用pip 安装rdkit

pip install rdkit-pypi
python -c "from rdkit import Chem; print(Chem.MolToMolBlock(Chem.MolFromSmiles('C1CCC1')))"

【讨论】：

错误：找不到满足rdkit-pypi要求的版本