将 R 连接到 Vertica DB 以进行数据转换和建模？

Posted 2023-05-07

【中文标题】将 R 连接到 Vertica DB 以进行数据转换和建模？

【英文标题】：Connect R to Vertica DB for data transformation and modelling?

【发布时间】：2018-08-01 15:13:13

【问题描述】：

我最近开始使用 DBVisualizer 开发 Vertica 数据库。鉴于我有 R 方面的经验并且很自在，任何人都可以帮助我了解从 R (RStudio) 连接到 Vertica 并执行查询所需的一切。

任何关于如何开始的文档将不胜感激。谢谢。

【问题讨论】：

我已经按照ODBC DSN 的官方文档并使用RODBC 包取得了成功。当我断开连接时，R 中总是有警告，但我认为可以忽略它们。

另见this question

【参考方案1】：

我们使用RJDBC 来完成该任务。示例：

library(RJDBC)
...
# load dataframe from an sql query
loadDataFromQuery <- function(query) 
  #library(RJDBC)
  strt <- Sys.time()
  vDriver <- JDBC(driverClass="com.vertica.jdbc.Driver", classPath="/opt/vertica/java/lib/vertica-jdk5.jar")
  vertica <- dbConnect(vDriver, "jdbc:vertica://myverticaserver.com:5433/somedb", "myuser", "mypass")
  df <- dbGetQuery(vertica, query)
  dbDisconnect(vertica)
  print(Sys.time()-strt)
  return(df)