conda更新后，使用matplotlib时python内核崩溃

Posted 2023-03-29

【中文标题】conda更新后，使用matplotlib时python内核崩溃

【英文标题】：After conda update, python kernel crashes when matplotlib is used

【发布时间】：2021-12-16 18:50:08

【问题描述】：

我用conda 创建了这个简单的环境：

conda create -n test python=3.8.5 pandas scipy numpy matplotlib seaborn jupyterlab

jupyter lab 中的以下代码使内核崩溃：

import matplotlib.pyplot as plt

plt.subplot()

我在Linux 上没有遇到问题。问题是当我尝试Windows 10。

jupyter lab 控制台（我启动服务器的地方）上没有错误，我不知道去哪里调查。

【参考方案1】：

2021 年 11 月 6 日更新

根据main / packages / freetype，conda 的默认 pkgs/main 频道已恢复为在 Windows 上使用 freetype 2.10.4。 如果您仍然遇到问题，请使用conda list freetype 检查版本：freetype != 2.11.0 如果是 2.11.0，则根据解决方案更改版本，或 conda update --all（前提是您的默认频道未在 .condarc 配置文件中更改）。

解决方案

如果在安装 Anaconda 后出现这种情况，请自 2021 年 10 月 27 日起更新 conda 或 freetype。 在任何受影响的环境中转到Anaconda 提示并降级freetype 2.11.0。 conda install freetype=2.10.4 与使用matplotlib 的任何包和任何IDE 相关 例如，pandas.DataFrame.plot 和 seaborn Jupyter、Spyder、VSCode、PyCharm、命令行。

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发现

使用来自 conda（10 月 29 日星期五发布）的最新更新进行更新后出现问题。 使用conda update --all 更新后，任何IDE 中与matplotlib 相关的任何内容都会出现问题（不仅仅是Jupyter）。 我在命令提示符下在JupyterLab、PyCharm 和python 中对此进行了测试。 PyCharm：Process finished with exit code -1073741819 JupyterLab：内核刚刚重新启动，没有相关的错误或 Traceback 命令提示：会短暂出现一个空白的交互式matplotlib窗口，然后出现一个新的命令行。 问题似乎在于(base) 中的conda update --all，然后任何使用matplotlib（例如seaborn 和pandas.DataFrame.plot）的绘图API 都会在任何环境中杀死内核。 我不得不重新安装 Anaconda，但

不要更新 (base)

，然后我的其他环境就可以工作了。 我还没有弄清楚具体是什么导致了这个问题。 我用python 3.8.12 和python 3.9.7 测试了这个问题 当前测试： 以下是conda 修订日志。 在conda update --all 之前，此环境可以正常工作，但在更新之后，使用matplotlib 绘图会使python 内核崩溃

  2021-10-31 10:47:22  (rev 3)
     bokeh  2.3.3 (defaults/win-64) -> 2.4.1 (defaults/win-64)
     click  8.0.1 (defaults/noarch) -> 8.0.3 (defaults/noarch)
     filelock  3.0.12 (defaults/noarch) -> 3.3.1 (defaults/noarch)
     freetype  2.10.4 (defaults/win-64) -> 2.11.0 (defaults/win-64)
     imagecodecs  2021.6.8 (defaults/win-64) -> 2021.8.26 (defaults/win-64)
     joblib  1.0.1 (defaults/noarch) -> 1.1.0 (defaults/noarch)
     lerc  2.2.1 (defaults/win-64) -> 3.0 (defaults/win-64)
     more-itertools  8.8.0 (defaults/noarch) -> 8.10.0 (defaults/noarch)
     pyopenssl  20.0.1 (defaults/noarch) -> 21.0.0 (defaults/noarch)
     scikit-learn  0.24.2 (defaults/win-64) -> 1.0.1 (defaults/win-64)
     statsmodels  0.12.2 (defaults/win-64) -> 0.13.0 (defaults/win-64)
     sympy  1.8 (defaults/win-64) -> 1.9 (defaults/win-64)
     tqdm  4.62.2 (defaults/noarch) -> 4.62.3 (defaults/noarch)
     xlwings  0.24.7 (defaults/win-64) -> 0.24.9 (defaults/win-64)

问题似乎是freetype 从2.11.0 降级到2.10.4 解决了这个问题并使环境与matplotlib 一起工作 去发布错误报告，发现有[Bug]: Matplotlib crashes Python #21511

【讨论】：

你绝对的超级巨星。对于你为我所做的事情，一个赞成票还不够，所以我要去你的个人资料，并增加你的其他一些答案：-D

@MikeAzatov 这个特定的问题/答案特定于freestyle 的问题。可能还有其他错误，或者可能只是我的安装问题。您可以随时回滚更新。见***.com/q/54172339/7758804

【参考方案2】：

我遇到了同样的问题，经过大量调查和故障排除后，修复非常简单：

conda update -c anaconda numpy

conda upgrade -c conda-forge matplotlib

之后它运行良好，我的视觉效果没有问题。

【讨论】：

这是一个糟糕的选择。它具有删除 45 个包、降级数百个包并将它们从 pkgs/main 切换到 anaconda channel 的效果，然后升级并切换到conda-forgechannel。这只是因为conda-forge 尚未将freestyle 2.11.0 合并到channel feedstock 中。更好的选择是接受的答案，它只会更改单个问题包的版本。

这对我有用。但我读了@TrentonMcKinney 的评论太晚了。有什么方法可以回滚到不涉及重新安装的更新版本？

@Nando Do conda update --all，它将使用默认的pkgs/main 频道，然后应用接受的答案。

@Nando Conda 跟踪修订。见conda list --revisions；使用conda install --revision <n>回滚。

查询是一个简单的 conda env，我提供了一个简单有效的修复。它不适用于您的基本 conda 环境。