无法 conda 构建 R 包

Posted 2023-02-16

【中文标题】无法 conda 构建 R 包

【英文标题】：Failing to conda build R package

【发布时间】：2018-12-04 21:49:58

【问题描述】：

我正在尝试使用 conda 和 Jupypter 编写一些 R 代码。我找到了一个名为“treatSens”的有用软件包，并尝试按照here 的说明通过 conda 安装。

conda install conda-build
conda skeleton cran treatSens
conda build r-treatsens
conda install -c local r-treatsens

然后我收到此错误conda_build.exceptions.DependencyNeedsBuildingError: Unsatisfiable dependencies for platform osx-64: "r-dbarts[version='>=0.9_1']"。我如何满足这种依赖？任何建议表示赞赏。

===更新====

添加了--recursive 然后我收到了一个新错误，发布了一个新问题 here.

【问题讨论】：

执行最后一条命令后是否显示此错误？之前是否有任何错误/警告？

@godot 是的，那是在最后一个命令之后。更新了问题，现在是关于 C 编译器的问题。

【参考方案1】：

尝试以下方法：

conda install conda-build
conda skeleton cran --recursive treatSens
conda build r-treatsens
conda install -c local r-treatsens

递归选项应该考虑到您需要的依赖关系。

【讨论】：

感谢您的回答。在安装依赖 dbarts 的过程中添加了递归并得到了关于 C 编译器的这个错误。我找到了这个github.com/ContinuumIO/anaconda-issues/issues/9872，但还不知道该怎么做

您使用的是 MacOS Mojave 吗？这里有一些关于它妨碍 32 位构建的注意事项：github.com/ValveSoftware/Proton/issues/108

是的，莫哈韦沙漠，我认为这是正确的方向。现在我需要弄清楚如何自定义 conda build 以使用正确的 C 编译器。我找到了conda.io/docs/user-guide/tasks/build-packages/…，但不知道如何设置