安装
编译环境
设置
- 加载 mpivars.[c]sh 脚本。
- 创建文本文件 mpd.hosts ，其中保存有集群的节点列表，每行一个名字
(只针对开发者) 确保环境变量 PATH 中包含有相应的编译器，比如 icc。
(只针对开发者) 使用适当的编译驱动编译测试程序，比如 mpiicc。
$ mpiicc -o test test.c - 使用 mpirun 运行测试程序
$ mpirun -r ssh -f mpd.hosts -n <# of processes> ./test
编译链接
- 保证在
PATH环境变量中编译器设置正确。使用Intel编译器，确保LD_LIBRARY_PATH环境变量中含有编译库的路径。 - 通过相应的 mpi 命令编译 MPI 程序。比如调用 mpicc 使用 GNU C 编译器：
$ mpicc <path-to-test>/test.c
(所以支持的编译器都有对应的以 mpi 开头的命令，比如 Intel Fortran (ifort ) 对应的为mpiifort).
运行MPI程序
设置 MPD 守护进程
Intel MPI 库使用 Multi-Purpose Daemon (MPD) 任务调度机制。为运行使用 mpiicc 编译的程序，首先需要设置好 MPD 守护进程。
与系统管理员为系统中所有用户启动一次 MPD 守护进程不同，用户需要启动和维护自己的一组 MPD 守护进程。这种设置增强了系统安全性，并为控制可执行程序的环境提供了更强的灵活性。
设置MPD的步骤如下：
- 设置相应的环境变量和目录。比如，在
.zshrc或.bashrc文件中：- 保证 PATH 变量中包含有
<installdir>/bin或者 Intel 64 位架构对应的<installdir>/bin64目录，其中<installdir>指的是 MPI 的安装路径。可 使用 Intel MPI 库中带有的mpivars.[c]sh来设置此变量。 - 确保 PATH 中包含有的 Python 至少为 2.2 或以上版本。
- 如果使用 Intel 编译器，确保
LD_LIBRARY_PATH变量包含有编译器的库目录。可使用编译器中带有的{icc,ifort}*vars.[c]sh脚本来设置。 - 设置应用程序所需要的其它环境变量。
- 保证 PATH 变量中包含有
创建
$HOME/.mpd.conf文件，设置 MPD 密码，需要在文件中写入一行：
secretword=<mpd secret word>
不要使用 Linux 登陆密码。<mpd secret word>可为任意字符串，它仅仅在不同的集群用户对 MPD 守护进程进行控制时有用。- 使用 chmod 设置
$HOME/.mpd.conf文件的权限
$ chmod 600 $HOME/.mpd.conf - 保证你在集群的所有节点上 rsh 命令看到同样的
PATH和.mpd.conf内容。 比如在集群的所有节点上执行下面的命令：
$ rsh <node> env
$ rsh <node> cat $HOME/.mpd.conf
保证每个节点都能够与其它任意节点连接。可使用安装中提供的sshconnectivity脚本。该脚本使用提供所有节点列表的文件作为参数，每个节点一行：
$ sshconnectivity.exp machines.LINUX
集群使用的是 ssh 而不是 rsh:- 需要确保任一节点与其它节点连 接时都不需要密码。这需要参照系统管理手册。
- 在启动 mpdboot 时需要加上调 用参数
-r ssh或--rsh=ssh
创建文本文件
mpd.hosts, 其中列出了集群中所有的节点，每行一个主机名。比如：
$ cat > mpd.hosts
node1
node2
...- 使用 mpdallexit 命令关闭上一次的 MPD 守护进程。
$ mpdallexit - 使用 mpdboot 命令启动 MPD 守护进程。
$ mpdboot -n <#nodes>
如果文件$PWD/mpd.hosts存在，则会被用作默认参数。如果没有主机名文件，启用mpdboot只会在本地机器上运行 MPD 守护进程。 - 使用
mpdtrace命令检查MPD守护进程的状态：
$ mpdtrace
其输出结果应该为当前进行 MPD 守护进程的节点列表。该列表应该与mpd.hosts文件中节点列表符合。
网络结构选择
Intel MPI 库会动态选择大部分适用的网络结构以便 MPI 进程之间进行通讯。设置环境变量 I_MPI_DEVICE为下表中的某个值：
| I_MPI_DEVICE 值 | 支持的结构 |
|---|---|
| sock | TCP/Ethernet/sockets |
| shm | Shared memory only (no sockets) |
| ssm | TCP + shared memory |
| rdma[: | InfiniBand, Myrinet (via specified DAPL provider) |
| rdssm[: | TCP + shared memory + DAPL |
要保证所选择的网络结构可用。比如，使用 shm 只有当所有进程可以通过共享内存进 行通讯时才行；使用 rdma 只有当所有进程可以通过单一的 DAPL 相互通讯时才行。
运行MPI程序
运行使用 Intel MPI 库连接的程序，使用 mpiexec 命令：
$ mpiexec -n <# of processes> ./myprog
使用 -n 参数设置进程数，这是 mpiexec 唯一需要明显指定的选项。
如果使用的网络结构与默认的不同，需要使用 -genv 选项来提供一个可以赋给 I_MPI_DEVICE 变量的值。
比如使用 shm 结构来运行 MPI 程序，可执行如下命令：
$ mpiexec -genv I_MPI_DEVICE shm -n <# of processes> ./myprog
比如使用 rdma 结构来运行 MPI 程序，可执行如下命令：
$ mpiexec -genv I_MPI_DEVICE rdma -n <# of processes> ./myprog
可以通过命令选择任何支持的设备。
如果应用程序运行成功，可将其移动到使用不同结构的集群中，不需要重新链接程序。