SNP (Single Nucleotide Polymorphism), SNV ( single nucleotide variants ) , Indel (insertion-deletion
Posted 橙子牛奶糖
tags:
篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了SNP (Single Nucleotide Polymorphism), SNV ( single nucleotide variants ) , Indel (insertion-deletion相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
SNP (Single Nucleotide Polymorphism):强调在一个群体中具有一定频率的变异，一般为二态性。比如G→C
SNV ( single nucleotide variants ) :包含多种单核苷酸变异，比如该位点可能由T变C，也可能由T变A。则T→C,A。SNV并没有强调在一个群体中具有一定的频率。
Indel (insertion-deletion) ：插入和缺失，涉及多个核苷酸的改变，插入：G→GTC, 缺失：GTC→G
以上是关于SNP (Single Nucleotide Polymorphism), SNV ( single nucleotide variants ) , Indel (insertion-deletion的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
r 用户R从PLINK分析单个SNP。使用有序logit模型分析SNP，SNP作为结果（通常它是完成的
shapeit提取或去除指定SNP和样本（shapeit extract or exclude SNP, sample）