24嵌合体序列
Posted 风中之铃
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了24嵌合体序列相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
转载:http://www.cnblogs.com/xudongliang/p/6497465.html
嵌合体序列:由来自两条或者多条模板链的序列组成,示意图如下:
在PCR反应中,在延伸阶段,由于不完全延伸,就会导致嵌合体序列的出现,以上图为例,
在扩增序列X的过程中,在序列延伸阶段,只产生了部分X序列延伸阶段就结束了,在下一轮的PCR反应中,这部分序列作为其相似序列Y的引物接着延伸,扩增就会形成X和Y的嵌合体序列;
在放一张具体一点的示意图,不完全延伸产生的序列作为下一轮PCR反应的产物,进行延伸
在PCR过程中,大概有1%的几率会出现嵌合体序列,所以在16S 扩增子测序的分析中,需要去除嵌合体序列
参考文章:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html
以上是关于24嵌合体序列的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
扩增子分析解读4去嵌合体 非细菌序列 生成代表性序列和OTU表
The sequence and de novo assembly of the giant panda genome.ppt
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