Storm实战常见问题及解决方案

Posted 唐僧吃肉

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Storm实战常见问题及解决方案相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

文档说明

该文档包涵了storm实战中经常遇到一些问题,及对应解决方案。这个文档是群里一个朋友在学习storm,并实战storm中遇到的一些问题,及和群里其他朋友一起交流给出的对应解决方案,并由他整理好,委托我发布出来(也算是交流者之一),供大家参考,希望能对大家有所帮助。

感谢 某某(哈哈 鉴于部分原因,不便透露名字~~~~!)…

 

问题锦集

 

1 关于Storm集群

 

1.1 关于storm集群的环境变量配置问题

安装好JDK后,需要配置环境变量,通常情况下出于经验,我们往往会修改/etc/profile的值进行环境变量配置,但这在安装JDK以及后面安装的storm集群、zookeeper集群以及metaq集群时会出问题,这时候我们需要在/etc/.bashrc文件中加入环境变量,不然安装的java和ZK集群等就无法使用,尤其这个问题在我用shell写调度脚本去启动storm集群的时候就遇到过,如果没有将java的环境变量配置在/etc/.bashrc文件中,就会报一个错,这个问题在后面我会提到。

1.2 关于zookeeper集群安装问题

记得刚刚接触storm,在安装zookeeper集群的时候有这样的考虑:为什么不可以把zookeeper只安装在nimbus上,然后让其他的supervisor来它这里读取任务?如果在每台机器上都安装zookeeper,那nimbus分配任务的时候,是每台机器上的zookeeper都收到同一份的任务,还是只是将分配给每个supervisor节点的那部分写到同一节点上的zookeeper中?

 

有朋友解答说:ZK也是以集群的方式工作的,ZK集群内部有他自己的一套相互通信机制,而storm正是要借助其通讯机制,例如任务下发等,往往在执行一个任务的时候,storm会把任务及相关执行的代码经过序列化之后发送到各个ZK节点供supervisor去下载,然后才会各自执行自己部分的代码或者任务。说的直接一点就是每个ZK节点收到的任务是一样的,而supervisor只需要下载属于自己的任务即可。

1.3 关于Storm中tuple 的可靠处理问题

Storm 为了保证tuple 的可靠处理,需要保存tuple 信息,这样会不会导致内存泄漏?

关于这个问题,其实网上是有资料进行了详细的解释的。这里只是大概将一下,如果还不明白,可以上网搜搜“storm可靠处理”。Storm 为了保证tuple 的可靠处理,acker 会保存该节点创建的tuple id的xor (异或)值,这个值称为ack value,那么每ack 一次,就将tuple id 和ack value做异或(xor)。当所有产生的tuple 都被ack 的时候,ack value 必定为0。这是个很简单的策略,对于每一个tuple 也只要占用约20 个字节的内存。对于100万tuple,也才20M 左右,所以一般情况下是不用考虑内存泄漏问题的。

1.4 关于storm计算结果的存放问题

很多人在刚刚学习Storm 的时候都会有这个问题:storm处理后的结果保存在哪里? 内存中?还是其他地方?

官方解释说: Storm 是不负责保存计算结果的,这是应用程序里需要负责的事情,如果数据不大,你可以简单地保存在内存里,也可以每次都更新数据库,也可以采用NoSQL存储。storm 并没有像s4 那样提供一个Persist API,根据时间或者容量来做存储输出。这部分事情完全交给用户。数据存储之后的展现,也是你需要自己处理的,storm UI 只提供对topology 的监控和统计。

1.5 关于Storm如何处理重复的tuple问题

有人问到Storm 是怎么处理重复的tuple?

因为Storm 要保证tuple 的可靠处理,当tuple 处理失败或者超时的时候,spout 会fail 并重新发送该tuple,那么就会有tuple 重复计算的问题。这个问题是很难解决的,storm 也没有提供机制帮助你解决。不过也有一些可行的策略:

(1)不处理,这也算是种策略。因为实时计算通常并不要求很高的精确度,后

续的批处理计算会更正实时计算的误差。

(2)使用第三方集中存储来过滤,比如利用mysql、MemCached 或者Redis 根据逻辑主键来去重。

(3)使用bloom filter 做过滤,简单高效。

1.6 关于task与executor的关系问题

在storm的学习过程中,有许多人问到task与executor的关系问题。

在我们安装配置storm的时候,不知大家是否主要到了一个问题,就是我们在配置的时候会加几个worker的端口( supervisor.slots.ports:),比如众多文档中提到的6700/6701等等类似的东西。没错,这就是我们定义了该supervisor最多的worker数,worker中执行一个bolt或者spout线程,我们就称之为task,而executor是物理上的线程概念,我们可以将其称为执行线程;而task更多是逻辑概念上的,有时候bolt与spout的task会共用一个executor,特别是在系统负荷比较高的时候。

1.7 关于Storm UI显示内容的问题

Storm UI 里spout 统计的complete latency 的具体含义是什么?为什么emit 的数目会是acked 的两倍?

简单地说,complete latency 表示了tuple 从emit 到被acked 经过的时间,可以认为是tuple 以及该tuple 的后续子孙(形成一棵树)整个处理时间。其次spout 的emit 和transfered 还统计了spout 和acker 之间内部的通信信息,比如对于可靠处理的spout 来说,会在emit 的时候同时发送一个_ack_init 给acker,记录tuple id 到task id 的映射,以便ack 的时候能找到正确的acker task。

1.8 关于Storm的ack和fail问题

在学习storm的过程中,有不少人对storm的Spout组件中的ack及fail相关的问题存在困惑,这里做一个简要的概述。

Storm保证每一个数据都得到有效处理,这是如何保证的呢?正是ack及fail机制确保数据都得到处理的保证,但是storm只是提供给我们一个接口,而具体的方法得由我们自己来实现。例如在spout下一个拓扑节点的bolt上,我们定义某种情况下为数据处理失败,则调用fail,则我们可以在fail方法中进行数据重发,这样就保证了数据都得到了处理。其实,通过读storm的源码,里面有讲到,有些类(BaseBasicBolt?)是会自动调用ack和fail的,不需要我们程序员去ack和fail,但是其他Bolt就没有这种功能了。

1.9 关于IRichBolt与IBasicBolt接口的区别

首先从类的组成上进行分析可以看到,IBasicBolt接口只有execute方法和declareOutputFields方法,而IRichBolt接口上除了以上几个方法还有prepare方法和cleanup及map方法。而且其中execute方法是有些不一样的,其参数列表不同。

总体来说Rich方法比较完善,我们可以使用prepare方法进行该Bolt类的初始化工作,例如我们链接数据库时,需要进行一次数据库连接操作,我们就可以把该操作放入prepare中,只需要执行一次就可以了。而cleanup方法能在该类调用结束时进行收尾工作,往往在处理数据的时候用到,例如在写hdfs(hadoop的文件系统)数据的时候,在结束时需要进行数据clear,则需要进行数据收尾。当然,根据官网及实际的测验,该方法往往是执行失败的。

 

2 关于Topology发布

 

2.1 发布topologies 到远程集群时,出现Nimbus host is not set 异常

原因是Nimbus 没有被正确启动起来,可能是storm.yaml 文件没有配置,或者配置有问题。

解决方法:打开storm.yaml 文件正确配置:nimbus.host: "xxx.xxx.xxx.xxx",重启nimbus 后台程序即可。

2.2 发布topology到远程集群时,出现AlreadyAliveException(msg: xxx is already active)异常

原因是提供的topology 与已经在运行的topology 重名。

解决方法:发布时换一个拓扑名称即可。

2.3 启动Supervisor 时,出现java.lang.UnsatisfiedLinkError

具体信息:启动Supervisor 时,出现java.lang.UnsatisfiedLinkError:

/usr/local/lib/libjzmq.so.0.0.0: libzmq.so.1: cannot open shared object

file: No such file or directory 异常。

原因是未找到zmq 动态链接库。

解决方法1:配置环境变量 export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib

解决方法2:编辑/etc/ld.so.conf 文件,增加一行:/usr/local/lib。再执行

sudo ldconfig 命令,重启Supervisor。

2.4 发布topologies 时,出现不能序列化log4j.Logger 的异常

原因是日志系统无法正确支付序列化。

解决方法:使用slf4j 代替log4j。

2.5 bolt 在处理消息时,worker 的日志中出现Failing message

原因:可能是因为Topology 的消息处理超时所致。

解决方法:提交Topology 时设置适当的消息超时时间,比默认消息超时时间(30

秒)更长。比如:

conf.setMessageTimeoutSecs(60);

2.6 在打包toplogy工程的时候, 如果采用assembly方式, 对于相关的依赖的配置一般要这样: 

Xml代码  

1.    

2.            

3.              /  

4.              true  

5.                

6.                  storm:storm  

7.                

8.            

9.        

 

wiki上说可以用compile。然后将storm依赖设置为runtime, 貌似不行。 另外就是所有的依赖包将全部解压, 然后将所有依赖的配置和class文件生成一个文件。这个是通过true参数来控制的。

2.7 在提交topology的时候有时可能出现如下异常: 

Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: Nimbus host is not set 
        at backtype.storm.utils.NimbusClient.(NimbusClient.java:30) 
        at backtype.storm.utils.NimbusClient.getConfiguredClient(NimbusClient.java:17) 
        at backtype.storm.StormSubmitter.submitJar(StormSubmitter.java:78) 
        at backtype.storm.StormSubmitter.submitJar(StormSubmitter.java:71) 
        at backtype.storm.StormSubmitter.submitTopology(StormSubmitter.java:50) 
        at com.taobao.kaleidoscope.storm.IcdbTopology.main(IcdbTopology.java:59)

 

但是启动nimbus是没有问题的, 这个主要因为conf_dir路径设置不正确, 在bin/storm脚本中需要加上这样一句: 

Python代码  

1.  CONF_DIR = STORM_DIR + "/conf"  

 

 

3 关于DRPC

 

3.1 发布drpc 类型的topologies 到远程集群时,出现空指针异常,连接drpc服务器失败

原因是未正确配置drpc 服务器地址。

解决方法:在conf/storm.yaml 文件中增加drpc 服务器配置,启动配置文件中

指定的所有drpc 服务。内容如下:

drpc.servers:

- "drpc 服务器ip"

3.2 客户端调用drpc 服务时,worker 的日志中出现Failing message,而bolt都未收到数据

错误日志如下所示:

2011-12-02 09:59:16 task [INFO] Failing message

[email protected]: source: 1:27,

stream: 1, id: {-5919451531315711689=-5919451531315711689},

[foo.com/blog/1, {"port":3772,"id":"5","host":"10.0.0.24"}]

 

原因是主机名,域名,hosts 文件配置不正确会引起这类错误。

解决方法:检查并修改storm 相关机器的主机名,域名,hosts 文件。重启网络服务:service network restart。重启storm,再次调用drpc 服务,成功。Hosts 文件中必须包含如下

内容:

[nimbus 主机ip] [nimbus 主机名] [nimbus 主机别名]

[supervisor 主机ip] [supervisor 主机名] [supervisor 主机别名]

[zookeeper 主机ip] [zookeeper 主机名] [zookeeper 主机别名]

 

4 关于jzmq安装

 

4.1 storm 启动时报no jzmq in java.library.path 错误

原因是找不到jzmq,默认情况下在执行install_zmq.sh 时,那些.so 文件

安装路径在/usr/local/lib,但是实际安装时可能装在其他的路径下了。

解决方法:在storm.yaml 中添加:

java.library.path:

"/opt/storm/jzmq/lib:/opt/storm/zeromq/lib:/usr/local/lib:/opt/local/

lib:/usr/lib"

4.2 安装jzmq 时遇到No rule to make target ‘classdist_noinst.stamp’的make 错误

具体的make 错误信息:

make[1]: *** No rule to make target `classdist_noinst.stamp‘,needed by `org/zeromq/ZMQ.class‘. Stop.

解决方法:手动创建classdist_noinst.stamp 空文件。

touch src/classdist_noinst.stamp

4.3 安装jzmq 时遇到cannot access org.zeromq.ZMQ 的make 错误

具体的make 错误信息:

error: cannot access org.zeromq.ZMQ class file for org.zeromq.ZMQ not found

javadoc: error - Class org.zeromq.ZMQ not found.

解决方法:手动编译,然后重新make 即可通过。

cd src

javac -d . org/zeromq/*.java

cd ..

4.4  在部署storm节点的时候需要安装jzmq和zeromq, 在安装这两个依赖包之后, 需要执行sudo -u root ldconfig. 否则会出现异常: 

2012-02-24 16:30:30 worker [ERROR] Error on initialization of server mk-worker 
java.lang.UnsatisfiedLinkError: /usr/local/lib/libjzmq.so.0.0.0: libzmq.so.1: cannot open shared object file: No such file or 
directory 
        at java.lang.ClassLoader$NativeLibrary.load(Native Method) 
        at java.lang.ClassLoader.loadLibrary0(ClassLoader.java:1803) 
        at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(ClassLoader.java:1728) 
        at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Runtime.java:823) 
        at java.lang.System.loadLibrary(System.java:1028) 
        at org.zeromq.ZMQ.(ZMQ.java:34)

 

5 关于Storm的配置问题

 

1.        yaml跟我们一般用的属性配置文件有所不同, 它的要求更严格一些, 因此在往conf/storm.yaml中添加配置的时候必须注意,比如必须注意开始位置和冒号后面的空格, 否则配置不会生效。

2.        如何检查配置是否生效?

可以使用命令: storm localconfvalue 配置关键字

 但是这个命令只能在nimbus上生效, 在supervisor看到的还是默认值. 不知道为什么 。

 

6 关闭storm相关进程

 

6.1 关闭nimbus相关进程: 

kill `ps aux | egrep ‘(daemon\.nimbus)|(storm\.ui\.core)‘ | fgrep -v egrep | awk ‘{print $2}‘` 

备注:这是在网上看到的,没有经过实际测试,有兴趣的朋友可以自己测试一下。

6.2 干掉supervisor上的所有storm进程: 

kill `ps aux | fgrep storm | fgrep -v ‘fgrep‘ | awk ‘{print $2}‘` 

备注:这是在网上看到的,没有经过实际测试,有兴趣的朋友可以自己测试一下。

 

7 关于Topology发布之后的log

 

1)        用storm jar ...将项目提交给storm集群后,想查看本项目的log信息,要到supervisor机器的:storm安装路径/logs/worker-number.log(其中的number视实际情况而定)中查看。

2)        如果是用daemontools启动的storm,daemontools监控的目录是/service/storm,那么到/service/storm/logs中查看worker-number.log日志。

3)        若要更改log的级别,是debug还是info等,在storm安装路径/log4j下有个配置文件,按需要修改即可。

4)        Storm的debug模式下,它本身的log非常庞大,所以我觉得自己的代码中有些重要的信息,用info比较好,这样将storm的log级别调整为info比较方便查看。

 

8 关于maven打包问题

 

8.1 首先maven的pom文件中的storm依赖,要么加exclude storm的相关语句(github有说明),要么加,如下:

                  

                            storm

                            storm

                            test

                  

加scope可以使打jar包时,不包含storm。如果包含了storm,那么提交到storm集群,会运行出错。官方要求打jar包时,要去除storm的依赖。

8.2 使用maven插件,在打jar包时,包含依赖。

在pom中加入:

       maven-assembly-plugin

      

             

                     jar-with-dependencies

             

             

                    

                            com.path.to.main.Class

                    

             

      

打jar包时使用命令:mvn assembly:assembly

8.3 依赖的jar冲突问题

如果本地依赖的jar与storm的lib下的jar有冲突,即都用了一个jar,但是版本不同,那么貌似目前只能改为跟storm保持统一。官方的讨论组是这样说的。

 

9 关于nimbus的启动问题

 

9.1 Storm nimbus启动失败

在使用了storm一段时间后,需要重新部署storm的集群,主要是想将storm部署在其它机器上。做了以下错误操作:

         1) 没有kill 正在运行的topology,kill nimbus和supervisor的storm进程

         2) 删除了配置中"storm.local.dir"的文件夹内的内容

         3) 启动storm nimbus

报错:
backtype.storm.daemon.nimbus 
[email protected] 
java.io.FileNotFoundException: File ‘/opt/apps-install/storm/ 
storm_local/nimbus/stormdist/appFailed-6-1325065153/stormconf.ser‘ 
does not exist 
        at 
org.apache.commons.io.FileUtils.openInputStream(FileUtils.java:137) 
        at 
org.apache.commons.io.FileUtils.readFileToByteArray(FileUtils.java: 
1135) 
        at backtype.storm.daemon.nimbus 
$read_storm_conf.invoke(nimbus.clj:128) 
        at backtype.storm.daemon.nimbus 
$compute_new_task__GT_node_PLUS_port.invoke(nimbus.clj:244) 
        at backtype.storm.daemon.nimbus 
$mk_assignments.invoke(nimbus.clj:288) 
        at backtype.storm.daemon.nimbus 
$fn__2692$exec_fn__945__auto____2693$this__2731.invoke(nimbus.clj:460) 
        at backtype.storm.event$event_manager 
$fn__2068$fn__2069.invoke(event.clj:25) 
        at backtype.storm.event$event_manager 
$fn__2068.invoke(event.clj:22) 
        at clojure.lang.AFn.run(AFn.java:24) 
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:662) 
2011-12-29 16:15:02 util [INFO] Halting process: ("Error when 
processing an event") 
报错原因:因为没有先kill topology,所以在启动nimbus时,zookeeper中依然保留了上次运行着的topology的信息。

解决办法:用zookeeper的zkCli.sh清理一下,我直接重装了zookeeper。但是据说在storm 0.6.1中解决了该bug。而我用的是storm 0.6.0。

 

10 Storm使用JVM参数

 

在配置文件storm.yaml中,有:

# to nimbus 
nimbus.childopts: "-Xmx1024m" 

# to supervisor 
supervisor.childopts: "-Xmx1024m" 

# to worker 
worker.childopts: "-Xmx768m" 
如果worker在运行时,需要用指定的JVM参数,那么可以像这样配置:
worker.childopts: "-Dworker=worker -Xmx768m -Xdebug –Xnoagent -Djava.compiler=NONE -Xrunjdwp:transport=dt_socket,address=8111,suspend=y,server=y " 

 

11 关于spout/bolt的生命周期

 

一般来说spout/bolt的生命周期如下:

1       在提交了一个topology之后(在nimbus所在的机器), 创建spout/bolt实例(spout/bolt在storm中统称为component)并进行序列化;

2       将序列化的component发送给所有的任务所在的机器;

3       在每一个任务上反序列化component;

4       在开始执行任务之前, 先执行component的初始化方法(bolt是prepare, spout是open);

因此component的初始化操作应该在prepare/open方法中进行, 而不是在实例化component的时候进行。

 

12关于storm与spring框架集成问题

 

 首先声明一下,这个问题是当时有考虑到是否可以将storm与spring集成时,在网上看到的一点介绍,只是为了日后做参考。

在进行storm与spring集成时,本来想着一次就能成功,抱着很大的希望可是运行时竟然报了个java.io.NotSerializableException的异常。该异常要求被依赖注入的jar包实现序列化接口,但那些jar包都是别人开发的你不能一个一个都改掉源码才能用到项目里。

再网上找一下还真有人遇到类似的问题,具体原因是对storm的spout和bolt的生命周期理解的不够深刻。

一般来说spout/bolt的生命周期如下:

1.在提交了一个topology之后(在nimbus所在的机器), 创建spout/bolt实例(spout/bolt在storm中统称为component)并进行序列化.

2.将序列化的component发送给所有的任务所在的机器

3.在每一个任务上反序列化component.

4.在开始执行任务之前, 先执行component的初始化方法(bolt是prepare, spout是open).

因此component的初始化操作应该在prepare/open方法中进行, 而不是在实例化component的时候进行.

按照这种说法进行改造,结构该问题消失了。但接下来又有了新的问题:

Caused by: org.xml.sax.SAXParseException: Content is not allowed in prolog.

这个异常网上搜索之后发现原来是由于*.xml文件编码的问题。原因是在从其他项目里或者编辑工具编辑时,在文件编码中加入了BOM头的原因,于是用notePad++打开xml文件选择去掉BOM头信息,重新进行保存即可。

 

13 关于java.lang.NoClassDefFoundError: clojure.core.protocols$

 

原因:JDK版本不匹配,安装虚拟机时系统自带一个jdk.1.5.0。

解决办法:检查jdk版本,卸载系统自带的JDK,使用自己安装的JDK版本。

         # rpm –qa | grep java

         #  rpm –e –nodeps java-*

配置环境变量,vi /etc/profile

重新执行一遍试试,貌似问题解决了。

 

14 关于storm连接Mysql

 

连接远程mysql是报如下错误:

message from server:"Host FILTER" is not allowed to connect to this MySQL server

解决方案:

很可能是你没有给其他IP访问你数据库的权限,你可以试试:

在MySql数据库的主机上,在mysql命令行中输入以下命令:

grant all on *.* to [email protected]‘%‘ identified by "111111" ;

这样,给任何IP都赋予了访问的权限,

任何IP都能以,用户名:root ,密码:111111

来进行局域网的访问!

(命令中*.*是通配任何IP,你也可以指定IP)

 

15 关于metaq启动的出现服务拒绝连接的问题

 

解决办法:在metaq安装目录下,删掉之前的日志文件,测试网络是否正常连接。将之前的服务的metaq进程kill掉,然后重启。

 

16 关于topology的spout与bolt

 

之前有问到,一个topology中可不可以有多个spout?这个问题貌似很幼稚啊,呵呵。关于这个问题,我是这样考虑的:实际应用中,如果我们每一条应用都创建一个topology的话,未免也太夸张了。如果是同一个应用,同一个数据来源,但是你想分几种方式对这个数据做处理的话,这时候就应该是建多个spout了,让这些spout并行去读数据,然后交给订阅这个spout的bolt去处理就行,没必要一种处理方式建一个topology。

 

17 关于shell脚本编码格式问题

 

这是我在写启动storm集群的shell脚本时遇到的一个实际问题。shell脚本运行时报错误:/bin/bash^M: bad interpreter

出现原因:windows上写的脚本,直接拷贝到linux系统上运行由于格式不兼容导致。

17.1 解决方案(一):

1. 比如文件名为myshell.sh,vim myshell.sh

2. 执行vim中的命令 : set ff?查看文件格式,如果显示fileformat=dos,证明文件格式有问题。

3. 执行vim中的命令 :set fileformat=unix 将文件格式改过来就可以了,然后:wq保存退出就可以了。

17.2 解决方案(二)

或者使用最笨的方法:将windows下编辑好的脚本通过txt文本格式转换,然后在拷贝到linux下。

如果是使用Notepad编辑器进行编辑的话,可以在菜单栏上选择“编辑”—“档案格式转换”—“转换为 UNIX 格式”。

 

最后说明一下,这些问题只是storm应用过程中遇到的一小部分问题,其实还有很多问题是涉及到实际项目的考虑的,比如集群硬件要求,参数配置,日志处理等等,具体问题具体分析吧,也希望哪些在实际项目中用到storm的大神们,能多多和大家分享你们的实际经验,毕竟实践出真知,任何新技术,只有经过实际应用和实际检验,分享出来的东西才有说服力。

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