DNA分子结构3D模型

Posted 2020-09-15 yutingliuyl

生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年，著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章全然给我们描写叙述了人类基因组測序未来的蓝图，可见3D技术在非常多领域都是发展方向。
使用mono能够高速的创建DNA分子结构立体模型，效果例如以下：



当然简单的呈现DNA分子结构，不过一部分功能，假设将mono和专业的DNA分析仪结合。不仅能够发现病症。更重要的是预測病症的发生，治病于未发，这将是人类的福音。除了研究人类基因之外，我们还能够对农作物的进行DNA3D模型化，并加以分析。对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。

使用mono创建3D模型最大的特点就是快。代码只是几十行，使用Editor更是不须要代码量。

本文的效果图通过代码实现。核心代码例如以下：

1	function createDNA(box, x, y, z, colors){

2	var count=20+Math.random()*50;

3	var dist=50;

4	var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,‘red‘);

5	for(var i=0;i<count;i++){

6	var angle=Math.PI*2/360*15*i;

7	var radius = (i % 2==0) ?  10 : 7;

8	var color = colors[i%2]

9	var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color);

10	var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color);

11	node1.setParent(parent);

12	node2.setParent(parent);

13

14	if(i % 2==0){

15	var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, ‘gray‘);

16	var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle,‘cyan‘);

17	var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle,‘cyan‘);

18	link.setParent(parent);

19	node3.setParent(parent);

20	node4.setParent(parent);

21

}

22

}

23	parent.setPosition(x,y,z);

24	parent.setStyle(‘m.visible‘,false);

25	return parent;

26

}

1	function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){

2	var x=size*Math.sin(angle);

3	var z=size*Math.cos(angle);

4	var y=index * 10;

5	var node = createNode(box, radius, x, y, z, color);

6	return node;

7

}