如何在geo数据库找想要的数据库

Posted 2023-04-22

参考技术A 1、首先GEO数据库是个什么鬼呢？
GEO数据库全称GENE EXPRESSION
OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。
2、那GEO数据库有哪些检索入口呢？
最常用的有两种方式，如果你知道GSE编号可以通过网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo直接进入，具体编号介绍文件下载方法见：https://www.omicsclass.com/article/1100
另外一种就是通过NCBI主页的入口基因搜索下载。通常是不知道GEO编号，通过样品类型，实验处理，平台信息等搜索筛选想要的GEO数据：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，进入NCBI主页，搜索数据选择GEO DataSets，如果搜索某个基因表达量可选择GEO Profiles。

GEO数据挖掘的深度不够？Oncomine数据挖掘不会选题？看这里

最近有问我们，感觉GEO数据挖掘的深度不够，有没有提高GEO数据挖掘的深度的方法呢？还有就是我们学会了Oncomine，但是不知道怎么样找目标基因，有没有方法呢？答案是有的，那就是将GEO联合Oncomine数据挖掘，既能提高GEO数据挖掘的深度，又能为Oncomine选题。为了满足一些学员的需求，我们录制了一套系统的课程。

写作套路

课程介绍

前言

如果你觉得GEO数据挖掘的深度不够，那就选择这门课程；如果你进行Oncomine分析，但是不会选题，那就选择这门课程。

课程内容：

系统地讲解如何将GEO和Oncomine联系起来进行分析，思路清晰，传授写出一篇SCI的技巧。

课程大纲：

1、课程介绍

2、GEO数据的下载

3、差异表达分析

4、绘制韦恩图（取交集差异基因）

5、GO分析

6、Pathway分析

7、PPI分析

8、筛选Hub基因

9、Oncomine分析（差异表达）

10、Oncomine分析（Meta分析）

11、生存分析

所有课程已经更新完毕。

课程特色：

讲解内容的讲解由浅到深，层层递进，提供练习数据、软件，老师在线解答学员的问题。

师资力量：

SCI狂人团队，擅长研究SCI论文写作套路，拥有一百多篇SCI的审稿经验，掌握多种编程语言，非常擅长meta分析和数据挖掘。

学员须知：

对课程有疑问，请联系微信QQXJ16; 本课程不能提供发票。

 

课程内容展示：

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