我的本科毕设

Posted 2020-09-06

《毕设题目》，老师给拟的，表示我自己看了题目都不知道我到底要干啥。。。

大概是说，利用学校的曙光集群里的MPI并行环境解决一个生物计算。什么生物计算？是对高维小样本数据进行聚类分析（大量的患有某种疾病的患者的DNA数据），分析得出病人的生存时间与哪个或那一组基因的关联最大。

导师提供资料：　　该生物计算的理论算法的论文（据说算法可靠），

　　　　　　　　　集群使用手册

　　　　　　　　　登陆集群账号

目前所了解：　　　集群提供环境：多节点并行运行，各种编译器，支持MPI，数学库，三个生物计算的软件

　　　　　　　　　算法所使用的思想和计算流程。。

　　　　　　　　　没了。

下一步目标：　　　确定以下= =　　

　　　　　　　　　　1，程序：语言（能够使用MPI的C语言），算法（学姐的毕业设计），数据结构
　　　　　　　　　　2，工具：在集群上到底怎么运行（是使用某个生物软件还是直接提交程序），

　　　　　　　　　　　如何提交程序（pbs学习，若使用生物软件，生物软件提供什么样的功能，如何使用。）
　　　　　　　　　　3，能否在实验计算机本地创建实验环境。

怎么办：：：：：：好好看看论文，弄清楚程序需要解决的功能有哪些，确定能否使用集群提供的生物计算软件解决

　　　　　　　　　了解集群利的三种生物软件各都能够提供哪些功能。

 

----------20170323