如何打开fasta文件

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了如何打开fasta文件相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

WINRAR可以解压.zip 文件,如果你不能打开,可能是WINRAR.exe有问题/版本太低/安装过别的解压软件破坏了文件关联,可

以重新安装(高版本)的WINRAR解决问题,你可以试试 WinACE Archiver,很好用的

如你安装了office/ACDsee/photoshop/WINRAR/FlashPlayer7.exe等,通常的(包括文本/图像/电子邮件/网页/压缩/Flash动画等

)文件都可以打开, 有些通常情况打不开的文件需要安装对应的软件,例如:.ISO需安装WinISO/.PDF需安装adobe等等.........

恕不能列举--太多了

“有些文件打开后都是一些看不懂的乱码,看不懂的符号”,分为几类情况:一是软件的语言或格式/文字设置不对/有的

字体库不全等,二是打开文件时使用的软件不对,假如用“记事本”打开.exe等文件通常是乱码,前者修改设置,后者安装对

路的软件,三是文件命的后缀(如.txt)与文件不符(如文件应是.exe),四是文件损坏,不能正常读取
参考技术A #!
/usr/bin/perl
-w
#启用perl
use
strict;
#启用严格的语法提示
open
(in,"1.fastq")||die
"open
error!\n";
#打开数据源文件1.fastq,如果打开失败则终止并输出提示
open
(out,">1.fasta")||die
"open
error!\n";
#打开输出文件1.fasta,如果打开失败则终止并输出提示
while
(
)#逐行读取数据源文件1.fastq内容
print
out
">",$1,"\n"
if
(/^@(.*)/);
#如果当前行内容以@开头,则将@换为>,后续内容不变
print
out
$_
if
(/^[atgc]/);
#如果当前行内容以a或t或g或c开头,则输出改行内容

#其他fastq行内容不输出到输出文件
close
(in);
#关闭数据源文件
close
(out);
#关闭输出文件
参考技术B 可以直接在打开方式中选择Office Word(任何版本的都可以),也可以用记事本打开

以上是关于如何打开fasta文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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