三维光流估计基于三维光流估计算法的医学器官运动估计

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了三维光流估计基于三维光流估计算法的医学器官运动估计相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1.软件版本

matlab2013b

2.本算法理论知识

 

 

 

 

 

3.部分源码

 

clc;
clear;
close all;
warning off;
 
tic;

len    = 76;
sizes  = 128;          %图片缩小比例,越小处理速度越快。由于3D图非常耗资源,所以得小点。。
areas  = min(64,sizes);%光流场计算范围缩放
sel    = 1;%是否显示原三维图

%1.读取图像数据
%1.读取图像数据
for pp = 1:10
    pp
    %读取连续的图片
    if pp  <= 9
       str1 = ['CT_PIC\\Export000',num2str(pp),'\\SR0000']
       str2 = ['CT_PIC\\Export000',num2str(pp),'\\SR0000\\*.jpg']
    else
       str1 = ['CT_PIC\\Export00',num2str(pp),'\\SR0000']
       str2 = ['CT_PIC\\Export00',num2str(pp),'\\SR0000\\*.jpg']    
    end
    folder     = str1;
    list       = dir(str2);
    I2         = func_read_serial_pic(folder,list,len,sizes);
    
    for i = 1:length(I2)
        D(:,:,i) = I2i;
    end  
    Imagespp = D;
end     
  
%显示三维图像
for pp = 1:10
   [x,y,z,D] = reducevolume(Imagespp,[1,1,1]);
   D = smooth3(D);
   if sel == 1
      figure;
      p  = patch(isosurface(x,y,z,D, 1,'verbose'), 'FaceColor', 'red', 'EdgeColor', 'none');
      p2 = patch(isocaps(x,y,z,D, 5), 'FaceColor', 'interp', 'EdgeColor', 'none');
      view(3); 
      axis square;  
      daspect([1 1 .4])
      colormap(gray(100))
      camlight; 
      lighting gouraud
      isonormals(x,y,z,D,p2);    
   end
   pause(0.01); 
end     
     
%2计算光流场
%2计算光流场
for i = 2:10
   [u,v,w]=func_cal_demons(Imagesi-1,Imagesi,1);
   Ui-1 = u;
   Vi-1 = v;
   Wi-1 = w;
end   

%显示三维光流场
step = 4;
[x,y,z]    = meshgrid(1:step:sizes,1:step:sizes,1:len);
 
for k = 1:9
    figure(20);
    for j = [10,20,30,40,50,60,70]%设置这个参数,可以减少或增加显示的数目,方便观察
        quiver3(x(:,:,j),y(:,:,j),z(:,:,j),Uk(1:step:sizes,1:step:sizes,j),Vk(1:step:sizes,1:step:sizes,j),Wk(1:step:sizes,1:step:sizes,j));
        axis([0,sizes,0,sizes,-5,80]);
        hold on
    end
    hold off
    pause(1);
end 


%3数据输出
%注意,MATLAB可将图像直接保存为ascii数据,然后你在Tecplot中进行调用

%4.计算时间统计分析
toc;

%5.释放存储空间,退出程序,这个步骤注释掉,方便观察每个步骤产生的数据;
%clc;
%clear all;

4.仿真结论

生成立体的心脏图片,其仿真结果如下所示:

通过仿真,可以得到如下的三维光流图:

5.参考文献

[1]基于冠状动脉造影图像序列的心脏及血管运动估计的研究.  2004.A09-27

以上是关于三维光流估计基于三维光流估计算法的医学器官运动估计的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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