编程R / Sweave以获得正确的 Sexpr输出
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了编程R / Sweave以获得正确的 Sexpr输出相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
我在为Sweave编程R时遇到了一些问题,#rstats twitter组经常指向这里,所以我想我会把这个问题提到SO人群中。我是一名分析师 - 而不是程序员 - 所以在我的第一篇文章中轻松一点。
问题在于:我正在起草一份带有R的Sweave调查报告,并希望使用Sexpr{}
报告边际收益。例如,而不是说:
只有14%的受访者表示'X'。
我想写这样的报告:
只有 Sexpr {p.mean(variable)} $ %$的受访者表示'X'。
问题是Sweave将Sexpr{}
中表达式的结果转换为字符串,这意味着R中表达式的输出和我文档中出现的输出是不同的。例如,上面我使用函数'p.mean':
p.mean<- function (x) {options(digits=1) mmm<-weighted.mean(x, weight=weight, na.rm=T) print(100*mmm) }
在R中,输出如下所示:
p.mean(variable) >14
但是当我使用Sexpr{p.mean(variable)}
时,我的文档中会得到一个未连接的字符串(在本例中为13.5857142857143)。我试图在全局环境,函数本身和各种命令中将我的函数输出限制为digits=1
。它似乎只包含R打印,而不是表达结果的字符转换,最终打印在LaTeX文件中。
as.character(p.mean(variable)) >[1] 14 >[1] "13.5857142857143"
有没有人知道我可以做什么来限制LaTeX文件中打印的数字,通过重新编程R函数或使用Sweave或Sexpr{}
中的设置?
@KennyTM得到了它。 @David,你应该避免使用options(digits = 1)
,因为它会影响你的所有计算(它会在之后的每个输出中抑制小数)。因此在应用round()
后使用weighted.mean()
函数。像这样的东西:
Sexpr{round(p.mean(x))}
并且不要使用print()
,但return()
。原因如下:
> set.seed(1234)
> x <- rnorm(100)
> foo <- function(x) {
res <- mean(x) + 5
print(res)
}
> foo(x)
[1] 5
> foo(x) + 10
[1] 5
[1] 15
使用return()
或只在最后一行输入结果变量:
> bar <- function(x) {
res <- mean(x) + 5
return(res)
}
> bar(x) + 10
[1] 15
所以,重写你的功能,并确保使用as.character()
...你有所有的位,现在只是把它们放在一起。
附:
我不确定你的功能如何起作用......我从未在分析中使用过加权平均值。令我困惑的是weight=weight
。在功能中多放一个参数会不会更好?坦率地说,我仍然惊讶于你的函数给你正确的结果......可能是因为你在函数定义之前定义了weight
变量。 [编辑]如果您没有预定义的weight
函数,您将无法获得函数的加权平均值,但“常规”意味着!
我希望这个帮助你!
亲切的问候,亚历山大
试试'格式':
options(digits=1)
然后:
Sexpr{format(p.mean(variable))}
您还可以使用'nsmall'参数:
options(digits=3)
...
Sexpr{format(sqrt(2)-0.41,nsmall=2)}
如果你熟悉C,你也可以试试'sprintf'。
as.character(round(p.mean(variable)))
?
sprintf()函数非常适合格式化数字输出。
siunitx包也可用于格式化sweave中的数字。
Code for Sweave
以下脚本显示了如何使用它来格式化数字,语法适用于Sweave。在序言中,您可以设置默认格式
sisetup{
round-mode = figures,
round-precision = 3
}
然后在命令Sexpr{num(pi,round_precision=2)}
中覆盖它
documentclass[a4paper]{article}
usepackage{siunitx}
usepackage{Sweave}
itle{siunitx}
sisetup{
round-mode = figures,
round-precision = 3
}
egin{document}
maketitle
<<sanitize_number,echo=FALSE>>=
num <- function(x,round_precision=NULL)
{
if (is.null(round_precision)) {
return(sprintf("\num{%s}", x))
} else {
return(sprintf("\num[round-precision=%s]{%s}",round_precision, x))
}
}
@
Examples :
round\_precision= 2 gives : Sexpr{num(pi,round_precision=2)}
round\_precision= 4 gives : Sexpr{num(pi,round_precision=4)}
Default formatting gives : Sexpr{num(pi)}
end{document}
Code for knitr
默认情况下,在knitr中,当设置选项options(digits = 2)
is时, Sexpr中的数字将被舍入。但是如果你想在不同的地方进行不同的舍入,下面的代码可以工作,它需要进行调整,因为不需要在编织器中的 Sexpr中双重逃避反义。
num <- function(x,round_precision=NULL)
{
if (is.null(round_precision)) {
return(sprintf("
um{%s}", x))
} else {
return(sprintf("
um[round-precision=%s]{%s}",round_precision, x))
}
}
以上是关于编程R / Sweave以获得正确的 Sexpr输出的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何在R / Sweave中的Sexpr中使用%in%? [重复]