Seurat | 单细胞分析工具
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了Seurat | 单细胞分析工具相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
Seurat是一个老牌的单细胞分析工具了(satija的力作),我之前测试过,但是没怎么用。
最近发现这个工具又publish在了NBT上,所以很有必要看一下这篇文章。
Integrating single-cell transcriptomic data across different conditions, technologies, and species
主要目的:identifying subpopulations of cells that are present across multiple data sets
主要就是为了多样品之间的比较,甚至不同物种间的对比。
Overview of Seurat alignment workflow
We aimed to develop a diverse integration strategy that could compare scRNA-seq data sets across different conditions, technologies, or species.
Identifying shared correlation structures across data sets
Machine-learning techniques for ‘data fusion’ aim to integrate information from multiple experiments into a consistent representation.
待续~
以上是关于Seurat | 单细胞分析工具的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
【单细胞测序数据分析-1】认识Seurat对象数据结构/数据格式及操作