生信学习-二代测序知乎专栏总结[转]
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转自:https://zhuanlan.zhihu.com/p/20702684
1.基本概念
- flowcell 是指Illumina测序时,测序反应发生的位置,1个flowcell含有8条lane
- lane 每一个flowcell上都有8条泳道,用于测序反应,可以添加试剂,洗脱等等
- tile 每一次测序荧光扫描的最小单位
- reads 指测序的结果,1条序列一般称为1条reads
- bp base pair 碱基对,用于衡量序列长度
- 双端测序 只一条序列可能比较长如500bp,我们可以两端每端各测150bp
- junction 上面说的双端测序,中间会留有200bp测不到的东西,我们叫junction
- adapter 就是测序中需要的一段特定的序列,有类似于引物的功能
- primer PCR中的引物
cDNA:complementary DNA互补脱氧核糖核酸。以一种逆转录酶,以mRNA为模板做成的复制品,将真核生物的基因(以mRNA的形式)复制到原核生物细胞中。
似乎看懂了,明天总结一下,并且看一下pdf!!!
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