冷冻电镜 - ChimeraX Density Map 密度图 操作

Posted SpikeKing

tags:

篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了冷冻电镜 - ChimeraX Density Map 密度图 操作相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

欢迎关注我的CSDN:https://spike.blog.csdn.net/
本文地址:https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/129055160

由冷冻电镜所生成的Volume,需要观察其内部结构,使用ChimeraX进行操作。

加载Volumes,例如my_volume.mrc

效果如下:

高斯滤波

在命令行(Command)中,输入:

volume gaussian #4

执行 Gaussian Filter 操作,“#”的数字对应Models中的ID编号。

高斯滤波之后的Volume,如下:

内部结构(Fit)

在ChimeraX中࿰

以上是关于冷冻电镜 - ChimeraX Density Map 密度图 操作的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析

冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析

基于冷冻电镜图像的低通滤波(Lowpass Filter)算法

CryoEM粒子(Particle)类型预测的数据集构建

CryoEM粒子(Particle)类型预测的数据集构建

CryoEM粒子(Particle)类型预测的数据集构建