关于头动

Posted 2020-12-06 yusani

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• 1. FSL MCFLIRT 的警告
  • 1.1 prestats页面给出头动警告的标准是什么？
  • 1.2 JISCMail里搜到这样说
  • 1.3 mean relative rms displacement ？
  • 1.4 Jenkinson 2002 NI

1. FSL MCFLIRT 的警告

1.1 prestats页面给出头动警告的标准是什么？

Mean displacements: absolute=1.62mm, relative=0.69mm - warning - high levels of motion detected

1.2 JISCMail里搜到这样说

Hi - this is when the mean relative rms displacement exceeds 0.5mm - but that is an arbitrary threshold…..
Cheers.
On 2 Nov 2010, at 18:19, Kirstie Whitaker wrote:
As a bonus question: sometimes when the children I scan move A LOT there is a warning in the mcflirt report that says "warning - high levels of motion detected ". Does anyone remember what your criteria for this warning is?

https://www.jiscmail.ac.uk/cgi-bin/webadmin?A2=ind1011&L=FSL&P=R10383

1.3 mean relative rms displacement ？

搜到严老师说(http://www.restfmri.net/forum/node/1307)：

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 01/05/2013 - 04:53 Permalink
Re: FD分析

1. 在RealignParameters文件夹下，会生成一个csv文件，报告每个被试的mean FD(Power)。这个值可以做为组分析的协变量。另外，在每个被试的文件夹下，也会有FD_Power_XXX.txt报告各个时间点的FD（Power）值。
2. 0.5是Power 2012a使用的阈值，在2012b中建议了0.2mm。在csv中，会报告按0.2去除的时间点数和百分比。
3. Mean FD 也在.csv中。这段话中的SD是指across subject的标准差。
4. FD power倾向于过份估计头动程度。另外，由于不同软件在做头动校正的时候，对于转动中心的假设不一样（SPM取决于头文件中定义的origin位置），因此FD power也受比较大的影响。DPARSF也输出FD_Jenkinson (Jenkinson 2002文章提到的relative RMS)，这种估计会补偿对转动中心的假设，应该更好一些。

1.4 Jenkinson 2002 NI

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1053811902911328

tbc